Protein–RNA interactions for Protein: P09874

PARP1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP1P09874 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PARP1P09874 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PARP1P09874 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PARP1P09874 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PARP1P09874 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PARP1P09874 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PARP1P09874 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PARP1P09874 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PARP1P09874 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PARP1P09874 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PARP1P09874 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PARP1P09874 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PARP1P09874 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PARP1P09874 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PARP1P09874 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PARP1P09874 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PARP1P09874 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PARP1P09874 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PARP1P09874 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PARP1P09874 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PARP1P09874 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PARP1P09874 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PARP1P09874 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PARP1P09874 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PARP1P09874 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PARP1P09874 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PARP1P09874 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PARP1P09874 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PARP1P09874 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PARP1P09874 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PARP1P09874 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PARP1P09874 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PARP1P09874 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PARP1P09874 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PARP1P09874 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PARP1P09874 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PARP1P09874 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PARP1P09874 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PARP1P09874 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PARP1P09874 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PARP1P09874 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PARP1P09874 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PARP1P09874 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PARP1P09874 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PARP1P09874 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PARP1P09874 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PARP1P09874 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PARP1P09874 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PARP1P09874 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PARP1P09874 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PARP1P09874 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PARP1P09874 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PARP1P09874 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PARP1P09874 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PARP1P09874 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PARP1P09874 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PARP1P09874 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PARP1P09874 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PARP1P09874 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PARP1P09874 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PARP1P09874 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PARP1P09874 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PARP1P09874 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PARP1P09874 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PARP1P09874 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PARP1P09874 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PARP1P09874 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PARP1P09874 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PARP1P09874 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PARP1P09874 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PARP1P09874 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PARP1P09874 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PARP1P09874 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PARP1P09874 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
PARP1P09874 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PARP1P09874 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PARP1P09874 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PARP1P09874 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PARP1P09874 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PARP1P09874 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PARP1P09874 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PARP1P09874 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PARP1P09874 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PARP1P09874 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PARP1P09874 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PARP1P09874 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PARP1P09874 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PARP1P09874 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PARP1P09874 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PARP1P09874 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PARP1P09874 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PARP1P09874 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PARP1P09874 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PARP1P09874 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PARP1P09874 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PARP1P09874 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PARP1P09874 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PARP1P09874 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PARP1P09874 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PARP1P09874 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms