Protein–RNA interactions for Protein: P08572

COL4A2, Collagen alpha-2(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A2P08572 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL4A2P08572 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL4A2P08572 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL4A2P08572 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL4A2P08572 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL4A2P08572 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL4A2P08572 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL4A2P08572 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL4A2P08572 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL4A2P08572 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL4A2P08572 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL4A2P08572 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL4A2P08572 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL4A2P08572 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL4A2P08572 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL4A2P08572 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL4A2P08572 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL4A2P08572 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL4A2P08572 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL4A2P08572 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL4A2P08572 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL4A2P08572 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
COL4A2P08572 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
COL4A2P08572 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
COL4A2P08572 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
COL4A2P08572 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL4A2P08572 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL4A2P08572 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL4A2P08572 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
COL4A2P08572 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL4A2P08572 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL4A2P08572 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL4A2P08572 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL4A2P08572 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL4A2P08572 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL4A2P08572 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
COL4A2P08572 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL4A2P08572 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL4A2P08572 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL4A2P08572 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL4A2P08572 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL4A2P08572 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL4A2P08572 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL4A2P08572 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL4A2P08572 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL4A2P08572 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
COL4A2P08572 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL4A2P08572 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL4A2P08572 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL4A2P08572 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL4A2P08572 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL4A2P08572 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL4A2P08572 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL4A2P08572 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL4A2P08572 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL4A2P08572 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL4A2P08572 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL4A2P08572 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL4A2P08572 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL4A2P08572 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL4A2P08572 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL4A2P08572 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL4A2P08572 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL4A2P08572 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL4A2P08572 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL4A2P08572 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL4A2P08572 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
COL4A2P08572 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL4A2P08572 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL4A2P08572 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL4A2P08572 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL4A2P08572 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL4A2P08572 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL4A2P08572 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL4A2P08572 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A2P08572 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A2P08572 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A2P08572 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A2P08572 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A2P08572 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A2P08572 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A2P08572 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A2P08572 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A2P08572 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A2P08572 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A2P08572 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
COL4A2P08572 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
COL4A2P08572 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COL4A2P08572 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
COL4A2P08572 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
COL4A2P08572 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL4A2P08572 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL4A2P08572 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL4A2P08572 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL4A2P08572 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL4A2P08572 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL4A2P08572 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL4A2P08572 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL4A2P08572 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL4A2P08572 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms