Protein–RNA interactions for Protein: P08183

ABCB1, Multidrug resistance protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB1P08183 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCB1P08183 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCB1P08183 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCB1P08183 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCB1P08183 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCB1P08183 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCB1P08183 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCB1P08183 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCB1P08183 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCB1P08183 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCB1P08183 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCB1P08183 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCB1P08183 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCB1P08183 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCB1P08183 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCB1P08183 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCB1P08183 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCB1P08183 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCB1P08183 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCB1P08183 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCB1P08183 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCB1P08183 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCB1P08183 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCB1P08183 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCB1P08183 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCB1P08183 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCB1P08183 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCB1P08183 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCB1P08183 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCB1P08183 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCB1P08183 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCB1P08183 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCB1P08183 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCB1P08183 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCB1P08183 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCB1P08183 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCB1P08183 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ABCB1P08183 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ABCB1P08183 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ABCB1P08183 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ABCB1P08183 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ABCB1P08183 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABCB1P08183 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABCB1P08183 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ABCB1P08183 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
ABCB1P08183 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
ABCB1P08183 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ABCB1P08183 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ABCB1P08183 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABCB1P08183 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ABCB1P08183 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABCB1P08183 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ABCB1P08183 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABCB1P08183 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABCB1P08183 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABCB1P08183 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ABCB1P08183 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ABCB1P08183 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABCB1P08183 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABCB1P08183 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABCB1P08183 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ABCB1P08183 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ABCB1P08183 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABCB1P08183 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABCB1P08183 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ABCB1P08183 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ABCB1P08183 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ABCB1P08183 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ABCB1P08183 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ABCB1P08183 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ABCB1P08183 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ABCB1P08183 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ABCB1P08183 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ABCB1P08183 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABCB1P08183 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ABCB1P08183 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABCB1P08183 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABCB1P08183 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ABCB1P08183 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ABCB1P08183 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABCB1P08183 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ABCB1P08183 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ABCB1P08183 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ABCB1P08183 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ABCB1P08183 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABCB1P08183 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABCB1P08183 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABCB1P08183 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ABCB1P08183 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABCB1P08183 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ABCB1P08183 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABCB1P08183 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ABCB1P08183 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABCB1P08183 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABCB1P08183 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABCB1P08183 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABCB1P08183 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABCB1P08183 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ABCB1P08183 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ABCB1P08183 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms