Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOA4P06727 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOA4P06727 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOA4P06727 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOA4P06727 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOA4P06727 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOA4P06727 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
APOA4P06727 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOA4P06727 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOA4P06727 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOA4P06727 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOA4P06727 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOA4P06727 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOA4P06727 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOA4P06727 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOA4P06727 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOA4P06727 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOA4P06727 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
APOA4P06727 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
APOA4P06727 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOA4P06727 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOA4P06727 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOA4P06727 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
APOA4P06727 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
APOA4P06727 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
APOA4P06727 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
APOA4P06727 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
APOA4P06727 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOA4P06727 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOA4P06727 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOA4P06727 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOA4P06727 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOA4P06727 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOA4P06727 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOA4P06727 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOA4P06727 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOA4P06727 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOA4P06727 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOA4P06727 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOA4P06727 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
APOA4P06727 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOA4P06727 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOA4P06727 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOA4P06727 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOA4P06727 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOA4P06727 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOA4P06727 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOA4P06727 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOA4P06727 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOA4P06727 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOA4P06727 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOA4P06727 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOA4P06727 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOA4P06727 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOA4P06727 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOA4P06727 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOA4P06727 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOA4P06727 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOA4P06727 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOA4P06727 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOA4P06727 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOA4P06727 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOA4P06727 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
APOA4P06727 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOA4P06727 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOA4P06727 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOA4P06727 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOA4P06727 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOA4P06727 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOA4P06727 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOA4P06727 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
APOA4P06727 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOA4P06727 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOA4P06727 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOA4P06727 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOA4P06727 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOA4P06727 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOA4P06727 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOA4P06727 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOA4P06727 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOA4P06727 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOA4P06727 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOA4P06727 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOA4P06727 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOA4P06727 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOA4P06727 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOA4P06727 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOA4P06727 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
APOA4P06727 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOA4P06727 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOA4P06727 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOA4P06727 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOA4P06727 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOA4P06727 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
APOA4P06727 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOA4P06727 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOA4P06727 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOA4P06727 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOA4P06727 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
APOA4P06727 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 316 ms