Protein–RNA interactions for Protein: P05165

PCCA, Propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCCAP05165 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCCAP05165 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCCAP05165 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCCAP05165 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCCAP05165 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCCAP05165 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCCAP05165 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCCAP05165 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCCAP05165 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCCAP05165 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCCAP05165 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCCAP05165 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PCCAP05165 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCCAP05165 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCCAP05165 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCCAP05165 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCCAP05165 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCCAP05165 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCCAP05165 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCCAP05165 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCCAP05165 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCCAP05165 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCCAP05165 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCCAP05165 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PCCAP05165 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PCCAP05165 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PCCAP05165 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PCCAP05165 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PCCAP05165 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PCCAP05165 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PCCAP05165 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PCCAP05165 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PCCAP05165 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCCAP05165 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCCAP05165 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCCAP05165 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCCAP05165 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCCAP05165 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCCAP05165 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCCAP05165 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCCAP05165 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCCAP05165 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCCAP05165 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCCAP05165 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCCAP05165 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PCCAP05165 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCCAP05165 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCCAP05165 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PCCAP05165 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCCAP05165 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCCAP05165 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCCAP05165 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PCCAP05165 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCCAP05165 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCCAP05165 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCCAP05165 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCCAP05165 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCCAP05165 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCCAP05165 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCCAP05165 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCCAP05165 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCCAP05165 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCCAP05165 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCCAP05165 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PCCAP05165 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PCCAP05165 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PCCAP05165 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PCCAP05165 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PCCAP05165 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PCCAP05165 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PCCAP05165 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PCCAP05165 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PCCAP05165 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PCCAP05165 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PCCAP05165 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCCAP05165 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCCAP05165 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCCAP05165 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCCAP05165 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCCAP05165 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PCCAP05165 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCCAP05165 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PCCAP05165 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCCAP05165 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCCAP05165 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PCCAP05165 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCCAP05165 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCCAP05165 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCCAP05165 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PCCAP05165 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCCAP05165 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCCAP05165 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCCAP05165 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCCAP05165 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCCAP05165 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCCAP05165 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCCAP05165 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCCAP05165 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCCAP05165 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCCAP05165 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms