Protein–RNA interactions for Protein: P05014

IFNA4, Interferon alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA4P05014 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
IFNA4P05014 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFNA4P05014 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFNA4P05014 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFNA4P05014 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFNA4P05014 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFNA4P05014 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFNA4P05014 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFNA4P05014 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFNA4P05014 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFNA4P05014 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
IFNA4P05014 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
IFNA4P05014 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
IFNA4P05014 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
IFNA4P05014 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
IFNA4P05014 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms