Protein–RNA interactions for Protein: P04278

SHBG, Sex hormone-binding globulin, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHBGP04278 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHBGP04278 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHBGP04278 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHBGP04278 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SHBGP04278 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHBGP04278 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHBGP04278 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHBGP04278 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHBGP04278 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHBGP04278 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SHBGP04278 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHBGP04278 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHBGP04278 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHBGP04278 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHBGP04278 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHBGP04278 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHBGP04278 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHBGP04278 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHBGP04278 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHBGP04278 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHBGP04278 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHBGP04278 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHBGP04278 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHBGP04278 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHBGP04278 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHBGP04278 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHBGP04278 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHBGP04278 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHBGP04278 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHBGP04278 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHBGP04278 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHBGP04278 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SHBGP04278 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHBGP04278 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHBGP04278 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SHBGP04278 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHBGP04278 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHBGP04278 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHBGP04278 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHBGP04278 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHBGP04278 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHBGP04278 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SHBGP04278 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHBGP04278 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHBGP04278 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHBGP04278 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHBGP04278 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHBGP04278 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHBGP04278 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHBGP04278 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHBGP04278 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHBGP04278 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHBGP04278 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHBGP04278 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHBGP04278 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHBGP04278 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHBGP04278 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHBGP04278 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHBGP04278 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHBGP04278 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHBGP04278 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHBGP04278 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHBGP04278 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHBGP04278 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHBGP04278 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SHBGP04278 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHBGP04278 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHBGP04278 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHBGP04278 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHBGP04278 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHBGP04278 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHBGP04278 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHBGP04278 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHBGP04278 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHBGP04278 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHBGP04278 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHBGP04278 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHBGP04278 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHBGP04278 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHBGP04278 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHBGP04278 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHBGP04278 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHBGP04278 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHBGP04278 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHBGP04278 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHBGP04278 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHBGP04278 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SHBGP04278 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHBGP04278 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHBGP04278 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHBGP04278 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHBGP04278 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHBGP04278 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHBGP04278 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHBGP04278 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHBGP04278 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SHBGP04278 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SHBGP04278 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHBGP04278 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHBGP04278 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms