Protein–RNA interactions for Protein: P04198

MYCN, N-myc proto-oncogene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNP04198 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYCNP04198 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYCNP04198 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYCNP04198 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYCNP04198 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYCNP04198 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYCNP04198 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYCNP04198 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYCNP04198 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYCNP04198 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYCNP04198 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYCNP04198 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYCNP04198 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYCNP04198 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYCNP04198 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYCNP04198 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYCNP04198 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYCNP04198 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
MYCNP04198 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYCNP04198 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYCNP04198 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
MYCNP04198 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYCNP04198 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYCNP04198 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYCNP04198 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYCNP04198 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYCNP04198 TNFRSF10A-AS1-201ENST00000518308 637 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYCNP04198 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYCNP04198 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYCNP04198 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYCNP04198 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYCNP04198 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MYCNP04198 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MYCNP04198 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MYCNP04198 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MYCNP04198 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MYCNP04198 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MYCNP04198 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MYCNP04198 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MYCNP04198 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MYCNP04198 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MYCNP04198 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MYCNP04198 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MYCNP04198 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MYCNP04198 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MYCNP04198 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MYCNP04198 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MYCNP04198 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MYCNP04198 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MYCNP04198 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MYCNP04198 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYCNP04198 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYCNP04198 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYCNP04198 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYCNP04198 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MYCNP04198 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MYCNP04198 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MYCNP04198 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MYCNP04198 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYCNP04198 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYCNP04198 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYCNP04198 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYCNP04198 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYCNP04198 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYCNP04198 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYCNP04198 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYCNP04198 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYCNP04198 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYCNP04198 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYCNP04198 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYCNP04198 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYCNP04198 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYCNP04198 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYCNP04198 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MYCNP04198 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MYCNP04198 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYCNP04198 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYCNP04198 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MYCNP04198 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYCNP04198 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYCNP04198 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYCNP04198 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYCNP04198 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
MYCNP04198 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYCNP04198 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYCNP04198 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYCNP04198 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYCNP04198 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYCNP04198 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYCNP04198 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYCNP04198 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYCNP04198 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYCNP04198 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MYCNP04198 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYCNP04198 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYCNP04198 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYCNP04198 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYCNP04198 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MYCNP04198 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYCNP04198 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms