Protein–RNA interactions for Protein: P04183

TK1, Thymidine kinase, cytosolic, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TK1P04183 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TK1P04183 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TK1P04183 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TK1P04183 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TK1P04183 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TK1P04183 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TK1P04183 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TK1P04183 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TK1P04183 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TK1P04183 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TK1P04183 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TK1P04183 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TK1P04183 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TK1P04183 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TK1P04183 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TK1P04183 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TK1P04183 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TK1P04183 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TK1P04183 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TK1P04183 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TK1P04183 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TK1P04183 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TK1P04183 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TK1P04183 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TK1P04183 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TK1P04183 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TK1P04183 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TK1P04183 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TK1P04183 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TK1P04183 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TK1P04183 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TK1P04183 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TK1P04183 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TK1P04183 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TK1P04183 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TK1P04183 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TK1P04183 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TK1P04183 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TK1P04183 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TK1P04183 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TK1P04183 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TK1P04183 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TK1P04183 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TK1P04183 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TK1P04183 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TK1P04183 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TK1P04183 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TK1P04183 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TK1P04183 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TK1P04183 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TK1P04183 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TK1P04183 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TK1P04183 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TK1P04183 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TK1P04183 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TK1P04183 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TK1P04183 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TK1P04183 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TK1P04183 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TK1P04183 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TK1P04183 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TK1P04183 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TK1P04183 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TK1P04183 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TK1P04183 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TK1P04183 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TK1P04183 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TK1P04183 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TK1P04183 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TK1P04183 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TK1P04183 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TK1P04183 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TK1P04183 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TK1P04183 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TK1P04183 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TK1P04183 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TK1P04183 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TK1P04183 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TK1P04183 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TK1P04183 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TK1P04183 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TK1P04183 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TK1P04183 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TK1P04183 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TK1P04183 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TK1P04183 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TK1P04183 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TK1P04183 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TK1P04183 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TK1P04183 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TK1P04183 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TK1P04183 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TK1P04183 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TK1P04183 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TK1P04183 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TK1P04183 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TK1P04183 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TK1P04183 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TK1P04183 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TK1P04183 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms