Protein–RNA interactions for Protein: P02730

SLC4A1, Band 3 anion transport protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A1P02730 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A1P02730 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A1P02730 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A1P02730 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A1P02730 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A1P02730 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A1P02730 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A1P02730 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A1P02730 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A1P02730 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A1P02730 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A1P02730 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A1P02730 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A1P02730 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A1P02730 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A1P02730 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A1P02730 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A1P02730 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A1P02730 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A1P02730 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A1P02730 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A1P02730 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A1P02730 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A1P02730 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A1P02730 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A1P02730 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A1P02730 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A1P02730 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A1P02730 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A1P02730 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A1P02730 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A1P02730 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A1P02730 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A1P02730 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A1P02730 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A1P02730 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A1P02730 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC4A1P02730 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC4A1P02730 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC4A1P02730 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC4A1P02730 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC4A1P02730 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC4A1P02730 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC4A1P02730 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC4A1P02730 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC4A1P02730 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC4A1P02730 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC4A1P02730 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC4A1P02730 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC4A1P02730 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC4A1P02730 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC4A1P02730 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC4A1P02730 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC4A1P02730 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC4A1P02730 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC4A1P02730 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC4A1P02730 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC4A1P02730 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC4A1P02730 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC4A1P02730 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC4A1P02730 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC4A1P02730 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC4A1P02730 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC4A1P02730 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC4A1P02730 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC4A1P02730 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC4A1P02730 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC4A1P02730 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC4A1P02730 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC4A1P02730 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC4A1P02730 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC4A1P02730 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC4A1P02730 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC4A1P02730 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC4A1P02730 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC4A1P02730 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC4A1P02730 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC4A1P02730 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC4A1P02730 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC4A1P02730 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC4A1P02730 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC4A1P02730 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC4A1P02730 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC4A1P02730 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC4A1P02730 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC4A1P02730 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC4A1P02730 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC4A1P02730 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC4A1P02730 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC4A1P02730 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC4A1P02730 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC4A1P02730 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC4A1P02730 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC4A1P02730 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC4A1P02730 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC4A1P02730 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC4A1P02730 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC4A1P02730 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC4A1P02730 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC4A1P02730 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms