Protein–RNA interactions for Protein: P01880

IGHD, Immunoglobulin heavy constant delta, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHDP01880 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IGHDP01880 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
IGHDP01880 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
IGHDP01880 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
IGHDP01880 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
IGHDP01880 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
IGHDP01880 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
IGHDP01880 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IGHDP01880 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IGHDP01880 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
IGHDP01880 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IGHDP01880 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IGHDP01880 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IGHDP01880 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IGHDP01880 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IGHDP01880 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IGHDP01880 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IGHDP01880 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IGHDP01880 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
IGHDP01880 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
IGHDP01880 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
IGHDP01880 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
IGHDP01880 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
IGHDP01880 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
IGHDP01880 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
IGHDP01880 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
IGHDP01880 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IGHDP01880 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IGHDP01880 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
IGHDP01880 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IGHDP01880 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IGHDP01880 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IGHDP01880 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IGHDP01880 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
IGHDP01880 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
IGHDP01880 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IGHDP01880 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IGHDP01880 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IGHDP01880 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IGHDP01880 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
IGHDP01880 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IGHDP01880 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IGHDP01880 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IGHDP01880 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
IGHDP01880 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IGHDP01880 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IGHDP01880 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
IGHDP01880 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IGHDP01880 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IGHDP01880 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IGHDP01880 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IGHDP01880 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IGHDP01880 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IGHDP01880 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IGHDP01880 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IGHDP01880 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IGHDP01880 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IGHDP01880 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IGHDP01880 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IGHDP01880 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
IGHDP01880 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IGHDP01880 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IGHDP01880 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IGHDP01880 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IGHDP01880 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IGHDP01880 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IGHDP01880 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IGHDP01880 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IGHDP01880 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IGHDP01880 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IGHDP01880 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IGHDP01880 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IGHDP01880 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IGHDP01880 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
IGHDP01880 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IGHDP01880 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
IGHDP01880 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IGHDP01880 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IGHDP01880 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
IGHDP01880 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IGHDP01880 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
IGHDP01880 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
IGHDP01880 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IGHDP01880 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IGHDP01880 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IGHDP01880 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IGHDP01880 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
IGHDP01880 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
IGHDP01880 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
IGHDP01880 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
IGHDP01880 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
IGHDP01880 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IGHDP01880 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IGHDP01880 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IGHDP01880 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IGHDP01880 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IGHDP01880 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IGHDP01880 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IGHDP01880 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IGHDP01880 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms