Protein–RNA interactions for Protein: P01133

EGF, Pro-epidermal growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFP01133 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EGFP01133 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EGFP01133 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EGFP01133 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EGFP01133 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EGFP01133 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EGFP01133 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EGFP01133 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EGFP01133 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EGFP01133 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EGFP01133 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EGFP01133 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EGFP01133 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EGFP01133 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EGFP01133 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EGFP01133 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EGFP01133 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EGFP01133 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EGFP01133 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EGFP01133 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EGFP01133 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EGFP01133 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EGFP01133 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EGFP01133 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EGFP01133 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
EGFP01133 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EGFP01133 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EGFP01133 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EGFP01133 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EGFP01133 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EGFP01133 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EGFP01133 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EGFP01133 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EGFP01133 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EGFP01133 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EGFP01133 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EGFP01133 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EGFP01133 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EGFP01133 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EGFP01133 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EGFP01133 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EGFP01133 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EGFP01133 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EGFP01133 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EGFP01133 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
EGFP01133 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EGFP01133 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EGFP01133 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EGFP01133 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EGFP01133 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
EGFP01133 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EGFP01133 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EGFP01133 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EGFP01133 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EGFP01133 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
EGFP01133 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EGFP01133 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EGFP01133 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EGFP01133 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EGFP01133 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EGFP01133 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EGFP01133 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EGFP01133 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EGFP01133 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EGFP01133 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EGFP01133 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EGFP01133 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EGFP01133 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EGFP01133 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
EGFP01133 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EGFP01133 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EGFP01133 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EGFP01133 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
EGFP01133 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EGFP01133 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EGFP01133 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EGFP01133 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EGFP01133 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EGFP01133 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EGFP01133 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EGFP01133 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EGFP01133 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EGFP01133 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EGFP01133 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EGFP01133 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EGFP01133 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EGFP01133 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
EGFP01133 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EGFP01133 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EGFP01133 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EGFP01133 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EGFP01133 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EGFP01133 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EGFP01133 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EGFP01133 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EGFP01133 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EGFP01133 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EGFP01133 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EGFP01133 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EGFP01133 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms