Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MBD3O95983 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MBD3O95983 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MBD3O95983 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MBD3O95983 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MBD3O95983 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
MBD3O95983 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MBD3O95983 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MBD3O95983 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MBD3O95983 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MBD3O95983 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MBD3O95983 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MBD3O95983 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MBD3O95983 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MBD3O95983 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MBD3O95983 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MBD3O95983 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MBD3O95983 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MBD3O95983 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MBD3O95983 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MBD3O95983 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
MBD3O95983 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
MBD3O95983 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MBD3O95983 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MBD3O95983 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MBD3O95983 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MBD3O95983 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MBD3O95983 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MBD3O95983 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MBD3O95983 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MBD3O95983 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MBD3O95983 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MBD3O95983 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MBD3O95983 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MBD3O95983 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MBD3O95983 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MBD3O95983 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MBD3O95983 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MBD3O95983 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MBD3O95983 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MBD3O95983 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MBD3O95983 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MBD3O95983 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
MBD3O95983 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MBD3O95983 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MBD3O95983 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MBD3O95983 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MBD3O95983 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MBD3O95983 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MBD3O95983 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MBD3O95983 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MBD3O95983 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MBD3O95983 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MBD3O95983 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MBD3O95983 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MBD3O95983 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MBD3O95983 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
MBD3O95983 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MBD3O95983 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MBD3O95983 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MBD3O95983 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MBD3O95983 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MBD3O95983 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MBD3O95983 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
MBD3O95983 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MBD3O95983 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MBD3O95983 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MBD3O95983 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MBD3O95983 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MBD3O95983 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MBD3O95983 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MBD3O95983 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MBD3O95983 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MBD3O95983 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MBD3O95983 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MBD3O95983 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MBD3O95983 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MBD3O95983 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
MBD3O95983 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MBD3O95983 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MBD3O95983 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MBD3O95983 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MBD3O95983 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MBD3O95983 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MBD3O95983 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MBD3O95983 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MBD3O95983 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MBD3O95983 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MBD3O95983 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MBD3O95983 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MBD3O95983 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MBD3O95983 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MBD3O95983 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MBD3O95983 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MBD3O95983 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MBD3O95983 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MBD3O95983 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MBD3O95983 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MBD3O95983 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MBD3O95983 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms