Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DDX58O95786 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DDX58O95786 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DDX58O95786 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
DDX58O95786 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
DDX58O95786 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
DDX58O95786 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DDX58O95786 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DDX58O95786 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DDX58O95786 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DDX58O95786 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DDX58O95786 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DDX58O95786 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DDX58O95786 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DDX58O95786 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DDX58O95786 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DDX58O95786 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DDX58O95786 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DDX58O95786 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DDX58O95786 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
DDX58O95786 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DDX58O95786 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DDX58O95786 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
DDX58O95786 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DDX58O95786 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
DDX58O95786 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
DDX58O95786 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DDX58O95786 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DDX58O95786 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
DDX58O95786 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DDX58O95786 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
DDX58O95786 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
DDX58O95786 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
DDX58O95786 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DDX58O95786 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DDX58O95786 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
DDX58O95786 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DDX58O95786 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
DDX58O95786 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
DDX58O95786 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
DDX58O95786 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DDX58O95786 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DDX58O95786 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DDX58O95786 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DDX58O95786 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DDX58O95786 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DDX58O95786 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DDX58O95786 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DDX58O95786 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DDX58O95786 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DDX58O95786 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DDX58O95786 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DDX58O95786 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DDX58O95786 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DDX58O95786 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DDX58O95786 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DDX58O95786 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DDX58O95786 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DDX58O95786 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
DDX58O95786 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DDX58O95786 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DDX58O95786 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DDX58O95786 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DDX58O95786 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DDX58O95786 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DDX58O95786 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DDX58O95786 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DDX58O95786 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DDX58O95786 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DDX58O95786 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DDX58O95786 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DDX58O95786 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DDX58O95786 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DDX58O95786 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DDX58O95786 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DDX58O95786 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DDX58O95786 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DDX58O95786 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DDX58O95786 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
DDX58O95786 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DDX58O95786 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DDX58O95786 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DDX58O95786 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DDX58O95786 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DDX58O95786 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DDX58O95786 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DDX58O95786 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DDX58O95786 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DDX58O95786 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DDX58O95786 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DDX58O95786 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DDX58O95786 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DDX58O95786 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DDX58O95786 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DDX58O95786 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DDX58O95786 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DDX58O95786 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DDX58O95786 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DDX58O95786 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DDX58O95786 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms