Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAPBO95292 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAPBO95292 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAPBO95292 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAPBO95292 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAPBO95292 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAPBO95292 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAPBO95292 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAPBO95292 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAPBO95292 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAPBO95292 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
VAPBO95292 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAPBO95292 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAPBO95292 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAPBO95292 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAPBO95292 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAPBO95292 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAPBO95292 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
VAPBO95292 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
VAPBO95292 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAPBO95292 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
VAPBO95292 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAPBO95292 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
VAPBO95292 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
VAPBO95292 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAPBO95292 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAPBO95292 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAPBO95292 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAPBO95292 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAPBO95292 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VAPBO95292 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VAPBO95292 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VAPBO95292 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VAPBO95292 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VAPBO95292 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VAPBO95292 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VAPBO95292 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VAPBO95292 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VAPBO95292 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VAPBO95292 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VAPBO95292 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VAPBO95292 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAPBO95292 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAPBO95292 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAPBO95292 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAPBO95292 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAPBO95292 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAPBO95292 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAPBO95292 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAPBO95292 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAPBO95292 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAPBO95292 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAPBO95292 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
VAPBO95292 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VAPBO95292 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VAPBO95292 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VAPBO95292 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VAPBO95292 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VAPBO95292 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VAPBO95292 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VAPBO95292 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VAPBO95292 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VAPBO95292 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VAPBO95292 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VAPBO95292 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VAPBO95292 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VAPBO95292 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VAPBO95292 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VAPBO95292 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VAPBO95292 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VAPBO95292 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VAPBO95292 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAPBO95292 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAPBO95292 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAPBO95292 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAPBO95292 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
VAPBO95292 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAPBO95292 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAPBO95292 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAPBO95292 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAPBO95292 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAPBO95292 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAPBO95292 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAPBO95292 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAPBO95292 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAPBO95292 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAPBO95292 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VAPBO95292 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VAPBO95292 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAPBO95292 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAPBO95292 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VAPBO95292 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAPBO95292 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAPBO95292 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
VAPBO95292 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAPBO95292 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAPBO95292 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAPBO95292 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAPBO95292 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAPBO95292 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms