Protein–RNA interactions for Protein: O94906

PRPF6, Pre-mRNA-processing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF6O94906 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF6O94906 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF6O94906 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF6O94906 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF6O94906 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF6O94906 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF6O94906 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF6O94906 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF6O94906 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF6O94906 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF6O94906 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF6O94906 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF6O94906 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF6O94906 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF6O94906 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF6O94906 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF6O94906 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF6O94906 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF6O94906 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF6O94906 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF6O94906 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF6O94906 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF6O94906 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF6O94906 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF6O94906 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF6O94906 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF6O94906 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF6O94906 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF6O94906 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF6O94906 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF6O94906 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF6O94906 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF6O94906 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF6O94906 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF6O94906 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF6O94906 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF6O94906 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF6O94906 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF6O94906 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF6O94906 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF6O94906 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF6O94906 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF6O94906 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF6O94906 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF6O94906 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF6O94906 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF6O94906 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF6O94906 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF6O94906 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF6O94906 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF6O94906 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF6O94906 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF6O94906 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF6O94906 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF6O94906 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF6O94906 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF6O94906 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF6O94906 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF6O94906 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF6O94906 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF6O94906 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF6O94906 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF6O94906 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF6O94906 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF6O94906 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF6O94906 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF6O94906 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF6O94906 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF6O94906 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF6O94906 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF6O94906 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF6O94906 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF6O94906 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF6O94906 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF6O94906 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF6O94906 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF6O94906 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF6O94906 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF6O94906 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF6O94906 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF6O94906 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF6O94906 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF6O94906 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF6O94906 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF6O94906 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF6O94906 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF6O94906 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF6O94906 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF6O94906 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF6O94906 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF6O94906 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF6O94906 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF6O94906 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF6O94906 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF6O94906 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF6O94906 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF6O94906 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF6O94906 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF6O94906 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF6O94906 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms