Protein–RNA interactions for Protein: O94856

NFASC, Neurofascin, humanhuman

Predictions only

Length 1,347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFASCO94856 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFASCO94856 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFASCO94856 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFASCO94856 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFASCO94856 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFASCO94856 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NFASCO94856 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFASCO94856 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFASCO94856 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFASCO94856 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFASCO94856 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NFASCO94856 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFASCO94856 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFASCO94856 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFASCO94856 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFASCO94856 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFASCO94856 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFASCO94856 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFASCO94856 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFASCO94856 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFASCO94856 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFASCO94856 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFASCO94856 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFASCO94856 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFASCO94856 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFASCO94856 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFASCO94856 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFASCO94856 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFASCO94856 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NFASCO94856 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFASCO94856 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NFASCO94856 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NFASCO94856 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFASCO94856 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFASCO94856 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NFASCO94856 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NFASCO94856 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NFASCO94856 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NFASCO94856 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NFASCO94856 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFASCO94856 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFASCO94856 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NFASCO94856 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NFASCO94856 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFASCO94856 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFASCO94856 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFASCO94856 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFASCO94856 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFASCO94856 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFASCO94856 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFASCO94856 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFASCO94856 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFASCO94856 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFASCO94856 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFASCO94856 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFASCO94856 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFASCO94856 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFASCO94856 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFASCO94856 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFASCO94856 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFASCO94856 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFASCO94856 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFASCO94856 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFASCO94856 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFASCO94856 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFASCO94856 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFASCO94856 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NFASCO94856 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFASCO94856 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFASCO94856 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NFASCO94856 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFASCO94856 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFASCO94856 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFASCO94856 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFASCO94856 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFASCO94856 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFASCO94856 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFASCO94856 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFASCO94856 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFASCO94856 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFASCO94856 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFASCO94856 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFASCO94856 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFASCO94856 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFASCO94856 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFASCO94856 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFASCO94856 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFASCO94856 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFASCO94856 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFASCO94856 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFASCO94856 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFASCO94856 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFASCO94856 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFASCO94856 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFASCO94856 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFASCO94856 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFASCO94856 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFASCO94856 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFASCO94856 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NFASCO94856 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms