Protein–RNA interactions for Protein: O76013

KRT36, Keratin, type I cuticular Ha6, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT36O76013 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT36O76013 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT36O76013 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT36O76013 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT36O76013 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT36O76013 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT36O76013 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT36O76013 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT36O76013 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT36O76013 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT36O76013 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT36O76013 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT36O76013 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT36O76013 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT36O76013 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT36O76013 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT36O76013 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT36O76013 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT36O76013 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT36O76013 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT36O76013 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT36O76013 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT36O76013 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT36O76013 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT36O76013 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT36O76013 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT36O76013 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT36O76013 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT36O76013 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT36O76013 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT36O76013 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT36O76013 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT36O76013 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT36O76013 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT36O76013 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT36O76013 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT36O76013 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT36O76013 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT36O76013 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT36O76013 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT36O76013 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT36O76013 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT36O76013 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT36O76013 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT36O76013 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT36O76013 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT36O76013 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT36O76013 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT36O76013 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT36O76013 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT36O76013 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT36O76013 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT36O76013 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT36O76013 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT36O76013 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT36O76013 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT36O76013 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT36O76013 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT36O76013 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT36O76013 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT36O76013 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT36O76013 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT36O76013 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT36O76013 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT36O76013 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
KRT36O76013 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT36O76013 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT36O76013 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT36O76013 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT36O76013 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT36O76013 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT36O76013 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT36O76013 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT36O76013 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT36O76013 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT36O76013 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT36O76013 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT36O76013 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT36O76013 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT36O76013 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT36O76013 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT36O76013 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT36O76013 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT36O76013 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT36O76013 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT36O76013 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT36O76013 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT36O76013 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT36O76013 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT36O76013 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT36O76013 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT36O76013 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT36O76013 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT36O76013 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT36O76013 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT36O76013 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT36O76013 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT36O76013 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT36O76013 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT36O76013 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms