Protein–RNA interactions for Protein: O75808

CAPN15, Calpain-15, humanhuman

Predictions only

Length 1,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN15O75808 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAPN15O75808 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAPN15O75808 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAPN15O75808 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAPN15O75808 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAPN15O75808 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAPN15O75808 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAPN15O75808 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAPN15O75808 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CAPN15O75808 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAPN15O75808 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAPN15O75808 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAPN15O75808 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAPN15O75808 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CAPN15O75808 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CAPN15O75808 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAPN15O75808 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAPN15O75808 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAPN15O75808 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAPN15O75808 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAPN15O75808 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAPN15O75808 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAPN15O75808 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAPN15O75808 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAPN15O75808 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAPN15O75808 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAPN15O75808 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CAPN15O75808 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAPN15O75808 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAPN15O75808 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAPN15O75808 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAPN15O75808 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAPN15O75808 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAPN15O75808 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAPN15O75808 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAPN15O75808 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAPN15O75808 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CAPN15O75808 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CAPN15O75808 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CAPN15O75808 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CAPN15O75808 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CAPN15O75808 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CAPN15O75808 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CAPN15O75808 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CAPN15O75808 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CAPN15O75808 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CAPN15O75808 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CAPN15O75808 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAPN15O75808 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAPN15O75808 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAPN15O75808 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAPN15O75808 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAPN15O75808 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAPN15O75808 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAPN15O75808 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAPN15O75808 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CAPN15O75808 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAPN15O75808 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAPN15O75808 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAPN15O75808 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAPN15O75808 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAPN15O75808 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAPN15O75808 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAPN15O75808 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAPN15O75808 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAPN15O75808 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAPN15O75808 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAPN15O75808 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAPN15O75808 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAPN15O75808 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAPN15O75808 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAPN15O75808 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAPN15O75808 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAPN15O75808 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAPN15O75808 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAPN15O75808 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAPN15O75808 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAPN15O75808 IL12A-202ENST00000466512 1283 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAPN15O75808 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAPN15O75808 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAPN15O75808 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CAPN15O75808 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CAPN15O75808 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CAPN15O75808 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAPN15O75808 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAPN15O75808 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAPN15O75808 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAPN15O75808 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAPN15O75808 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAPN15O75808 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAPN15O75808 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAPN15O75808 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CAPN15O75808 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CAPN15O75808 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CAPN15O75808 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAPN15O75808 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAPN15O75808 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAPN15O75808 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAPN15O75808 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAPN15O75808 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms