Protein–RNA interactions for Protein: O75530

EED, Polycomb protein EED, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEDO75530 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EEDO75530 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
EEDO75530 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EEDO75530 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EEDO75530 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
EEDO75530 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EEDO75530 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EEDO75530 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EEDO75530 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
EEDO75530 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EEDO75530 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EEDO75530 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EEDO75530 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
EEDO75530 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
EEDO75530 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EEDO75530 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EEDO75530 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EEDO75530 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EEDO75530 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EEDO75530 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EEDO75530 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EEDO75530 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EEDO75530 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EEDO75530 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EEDO75530 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
EEDO75530 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EEDO75530 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EEDO75530 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EEDO75530 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EEDO75530 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EEDO75530 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EEDO75530 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EEDO75530 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EEDO75530 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EEDO75530 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EEDO75530 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EEDO75530 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
EEDO75530 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EEDO75530 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EEDO75530 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EEDO75530 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EEDO75530 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EEDO75530 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EEDO75530 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EEDO75530 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EEDO75530 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EEDO75530 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EEDO75530 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EEDO75530 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EEDO75530 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EEDO75530 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EEDO75530 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EEDO75530 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
EEDO75530 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EEDO75530 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EEDO75530 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EEDO75530 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EEDO75530 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EEDO75530 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EEDO75530 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EEDO75530 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EEDO75530 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
EEDO75530 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EEDO75530 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EEDO75530 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EEDO75530 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EEDO75530 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EEDO75530 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EEDO75530 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EEDO75530 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EEDO75530 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
EEDO75530 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EEDO75530 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EEDO75530 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EEDO75530 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EEDO75530 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EEDO75530 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EEDO75530 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EEDO75530 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EEDO75530 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EEDO75530 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EEDO75530 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EEDO75530 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EEDO75530 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EEDO75530 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EEDO75530 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EEDO75530 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EEDO75530 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
EEDO75530 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EEDO75530 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EEDO75530 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EEDO75530 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EEDO75530 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EEDO75530 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EEDO75530 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EEDO75530 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EEDO75530 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EEDO75530 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EEDO75530 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EEDO75530 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms