Protein–RNA interactions for Protein: O75175

CNOT3, CCR4-NOT transcription complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT3O75175 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNOT3O75175 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNOT3O75175 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNOT3O75175 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNOT3O75175 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNOT3O75175 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNOT3O75175 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNOT3O75175 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNOT3O75175 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNOT3O75175 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNOT3O75175 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNOT3O75175 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNOT3O75175 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNOT3O75175 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNOT3O75175 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNOT3O75175 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNOT3O75175 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNOT3O75175 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNOT3O75175 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNOT3O75175 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNOT3O75175 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNOT3O75175 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNOT3O75175 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNOT3O75175 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNOT3O75175 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNOT3O75175 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNOT3O75175 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNOT3O75175 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNOT3O75175 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNOT3O75175 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNOT3O75175 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CNOT3O75175 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNOT3O75175 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNOT3O75175 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNOT3O75175 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNOT3O75175 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNOT3O75175 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNOT3O75175 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNOT3O75175 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNOT3O75175 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNOT3O75175 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNOT3O75175 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNOT3O75175 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNOT3O75175 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNOT3O75175 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CNOT3O75175 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNOT3O75175 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNOT3O75175 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNOT3O75175 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNOT3O75175 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNOT3O75175 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNOT3O75175 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNOT3O75175 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNOT3O75175 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CNOT3O75175 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNOT3O75175 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNOT3O75175 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNOT3O75175 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNOT3O75175 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNOT3O75175 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CNOT3O75175 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNOT3O75175 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNOT3O75175 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNOT3O75175 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNOT3O75175 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNOT3O75175 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNOT3O75175 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNOT3O75175 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNOT3O75175 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNOT3O75175 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNOT3O75175 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNOT3O75175 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNOT3O75175 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNOT3O75175 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNOT3O75175 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNOT3O75175 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNOT3O75175 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNOT3O75175 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNOT3O75175 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNOT3O75175 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNOT3O75175 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNOT3O75175 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNOT3O75175 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNOT3O75175 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNOT3O75175 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNOT3O75175 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNOT3O75175 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNOT3O75175 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CNOT3O75175 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNOT3O75175 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNOT3O75175 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CNOT3O75175 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNOT3O75175 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNOT3O75175 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNOT3O75175 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNOT3O75175 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNOT3O75175 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CNOT3O75175 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNOT3O75175 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNOT3O75175 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms