Protein–RNA interactions for Protein: O75167

PHACTR2, Phosphatase and actin regulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR2O75167 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHACTR2O75167 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHACTR2O75167 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHACTR2O75167 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHACTR2O75167 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHACTR2O75167 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHACTR2O75167 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHACTR2O75167 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHACTR2O75167 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHACTR2O75167 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHACTR2O75167 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHACTR2O75167 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHACTR2O75167 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHACTR2O75167 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHACTR2O75167 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHACTR2O75167 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHACTR2O75167 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHACTR2O75167 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHACTR2O75167 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHACTR2O75167 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHACTR2O75167 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHACTR2O75167 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHACTR2O75167 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHACTR2O75167 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHACTR2O75167 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHACTR2O75167 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHACTR2O75167 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHACTR2O75167 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHACTR2O75167 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHACTR2O75167 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHACTR2O75167 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHACTR2O75167 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHACTR2O75167 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHACTR2O75167 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHACTR2O75167 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHACTR2O75167 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHACTR2O75167 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHACTR2O75167 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHACTR2O75167 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHACTR2O75167 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHACTR2O75167 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHACTR2O75167 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHACTR2O75167 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHACTR2O75167 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHACTR2O75167 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHACTR2O75167 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHACTR2O75167 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHACTR2O75167 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHACTR2O75167 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHACTR2O75167 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHACTR2O75167 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHACTR2O75167 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHACTR2O75167 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHACTR2O75167 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHACTR2O75167 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHACTR2O75167 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHACTR2O75167 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHACTR2O75167 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHACTR2O75167 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHACTR2O75167 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHACTR2O75167 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHACTR2O75167 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHACTR2O75167 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHACTR2O75167 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHACTR2O75167 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHACTR2O75167 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHACTR2O75167 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHACTR2O75167 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHACTR2O75167 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHACTR2O75167 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHACTR2O75167 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHACTR2O75167 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHACTR2O75167 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHACTR2O75167 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHACTR2O75167 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PHACTR2O75167 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHACTR2O75167 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHACTR2O75167 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PHACTR2O75167 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PHACTR2O75167 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PHACTR2O75167 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHACTR2O75167 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHACTR2O75167 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHACTR2O75167 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHACTR2O75167 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHACTR2O75167 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHACTR2O75167 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHACTR2O75167 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHACTR2O75167 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHACTR2O75167 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHACTR2O75167 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHACTR2O75167 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHACTR2O75167 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHACTR2O75167 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHACTR2O75167 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PHACTR2O75167 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHACTR2O75167 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHACTR2O75167 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHACTR2O75167 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHACTR2O75167 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms