Protein–RNA interactions for Protein: O75110

ATP9A, Probable phospholipid-transporting ATPase IIA, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9AO75110 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP9AO75110 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP9AO75110 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP9AO75110 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP9AO75110 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP9AO75110 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP9AO75110 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP9AO75110 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP9AO75110 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP9AO75110 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP9AO75110 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP9AO75110 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP9AO75110 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP9AO75110 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP9AO75110 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP9AO75110 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP9AO75110 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP9AO75110 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP9AO75110 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP9AO75110 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP9AO75110 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP9AO75110 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP9AO75110 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP9AO75110 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP9AO75110 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP9AO75110 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP9AO75110 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP9AO75110 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP9AO75110 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP9AO75110 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP9AO75110 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP9AO75110 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP9AO75110 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP9AO75110 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP9AO75110 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP9AO75110 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP9AO75110 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP9AO75110 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP9AO75110 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP9AO75110 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP9AO75110 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP9AO75110 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP9AO75110 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP9AO75110 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP9AO75110 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP9AO75110 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP9AO75110 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP9AO75110 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP9AO75110 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP9AO75110 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP9AO75110 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP9AO75110 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP9AO75110 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP9AO75110 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP9AO75110 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP9AO75110 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP9AO75110 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP9AO75110 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP9AO75110 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP9AO75110 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP9AO75110 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP9AO75110 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP9AO75110 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP9AO75110 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP9AO75110 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP9AO75110 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP9AO75110 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP9AO75110 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP9AO75110 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP9AO75110 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP9AO75110 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP9AO75110 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ATP9AO75110 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP9AO75110 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP9AO75110 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP9AO75110 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP9AO75110 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP9AO75110 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP9AO75110 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP9AO75110 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP9AO75110 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP9AO75110 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP9AO75110 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP9AO75110 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP9AO75110 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP9AO75110 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP9AO75110 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP9AO75110 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP9AO75110 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP9AO75110 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP9AO75110 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP9AO75110 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP9AO75110 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP9AO75110 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP9AO75110 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP9AO75110 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP9AO75110 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP9AO75110 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP9AO75110 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP9AO75110 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms