Protein–RNA interactions for Protein: O60941

DTNB, Dystrobrevin beta, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTNBO60941 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DTNBO60941 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DTNBO60941 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DTNBO60941 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DTNBO60941 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
DTNBO60941 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DTNBO60941 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DTNBO60941 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
DTNBO60941 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
DTNBO60941 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DTNBO60941 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DTNBO60941 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DTNBO60941 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DTNBO60941 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DTNBO60941 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DTNBO60941 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DTNBO60941 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DTNBO60941 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DTNBO60941 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DTNBO60941 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DTNBO60941 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DTNBO60941 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
DTNBO60941 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DTNBO60941 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DTNBO60941 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DTNBO60941 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DTNBO60941 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DTNBO60941 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DTNBO60941 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DTNBO60941 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DTNBO60941 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
DTNBO60941 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
DTNBO60941 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DTNBO60941 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DTNBO60941 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DTNBO60941 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DTNBO60941 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DTNBO60941 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DTNBO60941 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DTNBO60941 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DTNBO60941 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DTNBO60941 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
DTNBO60941 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DTNBO60941 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DTNBO60941 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DTNBO60941 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DTNBO60941 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DTNBO60941 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DTNBO60941 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DTNBO60941 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DTNBO60941 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DTNBO60941 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DTNBO60941 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DTNBO60941 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DTNBO60941 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DTNBO60941 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DTNBO60941 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DTNBO60941 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DTNBO60941 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DTNBO60941 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DTNBO60941 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DTNBO60941 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DTNBO60941 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DTNBO60941 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DTNBO60941 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DTNBO60941 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DTNBO60941 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DTNBO60941 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DTNBO60941 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DTNBO60941 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DTNBO60941 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
DTNBO60941 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DTNBO60941 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DTNBO60941 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
DTNBO60941 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
DTNBO60941 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
DTNBO60941 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DTNBO60941 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DTNBO60941 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DTNBO60941 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DTNBO60941 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DTNBO60941 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DTNBO60941 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DTNBO60941 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DTNBO60941 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DTNBO60941 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DTNBO60941 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DTNBO60941 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DTNBO60941 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DTNBO60941 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DTNBO60941 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DTNBO60941 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DTNBO60941 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DTNBO60941 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DTNBO60941 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DTNBO60941 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DTNBO60941 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DTNBO60941 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DTNBO60941 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DTNBO60941 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms