Protein–RNA interactions for Protein: O60318

MCM3AP, Germinal-center associated nuclear protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3APO60318 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCM3APO60318 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCM3APO60318 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCM3APO60318 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCM3APO60318 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCM3APO60318 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCM3APO60318 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCM3APO60318 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCM3APO60318 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCM3APO60318 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCM3APO60318 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCM3APO60318 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCM3APO60318 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCM3APO60318 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCM3APO60318 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCM3APO60318 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCM3APO60318 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MCM3APO60318 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MCM3APO60318 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MCM3APO60318 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MCM3APO60318 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
MCM3APO60318 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MCM3APO60318 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MCM3APO60318 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
MCM3APO60318 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MCM3APO60318 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MCM3APO60318 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCM3APO60318 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCM3APO60318 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCM3APO60318 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCM3APO60318 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MCM3APO60318 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCM3APO60318 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCM3APO60318 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCM3APO60318 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCM3APO60318 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCM3APO60318 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCM3APO60318 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCM3APO60318 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCM3APO60318 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCM3APO60318 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCM3APO60318 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCM3APO60318 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCM3APO60318 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCM3APO60318 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCM3APO60318 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCM3APO60318 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCM3APO60318 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCM3APO60318 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCM3APO60318 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCM3APO60318 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCM3APO60318 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCM3APO60318 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCM3APO60318 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCM3APO60318 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCM3APO60318 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCM3APO60318 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
MCM3APO60318 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
MCM3APO60318 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCM3APO60318 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCM3APO60318 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCM3APO60318 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCM3APO60318 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCM3APO60318 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCM3APO60318 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCM3APO60318 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCM3APO60318 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCM3APO60318 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCM3APO60318 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCM3APO60318 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCM3APO60318 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MCM3APO60318 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCM3APO60318 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCM3APO60318 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCM3APO60318 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCM3APO60318 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCM3APO60318 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCM3APO60318 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCM3APO60318 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCM3APO60318 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCM3APO60318 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCM3APO60318 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCM3APO60318 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MCM3APO60318 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCM3APO60318 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCM3APO60318 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCM3APO60318 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MCM3APO60318 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCM3APO60318 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCM3APO60318 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCM3APO60318 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCM3APO60318 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCM3APO60318 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCM3APO60318 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MCM3APO60318 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCM3APO60318 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCM3APO60318 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCM3APO60318 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCM3APO60318 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCM3APO60318 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms