Protein–RNA interactions for Protein: O43921

EFNA2, Ephrin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA2O43921 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNA2O43921 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNA2O43921 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNA2O43921 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNA2O43921 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNA2O43921 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNA2O43921 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNA2O43921 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNA2O43921 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNA2O43921 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNA2O43921 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNA2O43921 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNA2O43921 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNA2O43921 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNA2O43921 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNA2O43921 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNA2O43921 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNA2O43921 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNA2O43921 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNA2O43921 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNA2O43921 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNA2O43921 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNA2O43921 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNA2O43921 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFNA2O43921 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFNA2O43921 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFNA2O43921 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFNA2O43921 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFNA2O43921 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFNA2O43921 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFNA2O43921 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFNA2O43921 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFNA2O43921 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFNA2O43921 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFNA2O43921 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
EFNA2O43921 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFNA2O43921 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFNA2O43921 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFNA2O43921 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFNA2O43921 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFNA2O43921 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
EFNA2O43921 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
EFNA2O43921 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFNA2O43921 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFNA2O43921 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFNA2O43921 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFNA2O43921 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFNA2O43921 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFNA2O43921 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFNA2O43921 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFNA2O43921 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFNA2O43921 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFNA2O43921 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFNA2O43921 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFNA2O43921 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFNA2O43921 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
EFNA2O43921 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFNA2O43921 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
EFNA2O43921 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFNA2O43921 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFNA2O43921 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFNA2O43921 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFNA2O43921 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
EFNA2O43921 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFNA2O43921 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
EFNA2O43921 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFNA2O43921 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
EFNA2O43921 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFNA2O43921 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFNA2O43921 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFNA2O43921 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
EFNA2O43921 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFNA2O43921 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFNA2O43921 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFNA2O43921 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFNA2O43921 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFNA2O43921 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFNA2O43921 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFNA2O43921 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFNA2O43921 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFNA2O43921 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFNA2O43921 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFNA2O43921 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFNA2O43921 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFNA2O43921 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFNA2O43921 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFNA2O43921 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFNA2O43921 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFNA2O43921 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFNA2O43921 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFNA2O43921 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFNA2O43921 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
EFNA2O43921 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
EFNA2O43921 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
EFNA2O43921 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFNA2O43921 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFNA2O43921 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFNA2O43921 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFNA2O43921 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
EFNA2O43921 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms