Protein–RNA interactions for Protein: O43765

SGTA, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTAO43765 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGTAO43765 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGTAO43765 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGTAO43765 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SGTAO43765 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGTAO43765 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGTAO43765 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGTAO43765 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGTAO43765 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGTAO43765 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGTAO43765 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGTAO43765 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGTAO43765 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGTAO43765 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGTAO43765 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGTAO43765 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGTAO43765 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGTAO43765 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SGTAO43765 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGTAO43765 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGTAO43765 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGTAO43765 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGTAO43765 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGTAO43765 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGTAO43765 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGTAO43765 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGTAO43765 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGTAO43765 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGTAO43765 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGTAO43765 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGTAO43765 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGTAO43765 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGTAO43765 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGTAO43765 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGTAO43765 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGTAO43765 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGTAO43765 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGTAO43765 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGTAO43765 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGTAO43765 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGTAO43765 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGTAO43765 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGTAO43765 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGTAO43765 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGTAO43765 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGTAO43765 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SGTAO43765 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SGTAO43765 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SGTAO43765 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGTAO43765 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGTAO43765 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGTAO43765 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGTAO43765 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGTAO43765 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGTAO43765 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGTAO43765 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGTAO43765 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SGTAO43765 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGTAO43765 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGTAO43765 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGTAO43765 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGTAO43765 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGTAO43765 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SGTAO43765 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGTAO43765 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGTAO43765 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SGTAO43765 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGTAO43765 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SGTAO43765 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGTAO43765 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGTAO43765 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGTAO43765 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGTAO43765 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGTAO43765 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGTAO43765 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGTAO43765 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SGTAO43765 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGTAO43765 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGTAO43765 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGTAO43765 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGTAO43765 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGTAO43765 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGTAO43765 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGTAO43765 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGTAO43765 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGTAO43765 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGTAO43765 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGTAO43765 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGTAO43765 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGTAO43765 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGTAO43765 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGTAO43765 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGTAO43765 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGTAO43765 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGTAO43765 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGTAO43765 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGTAO43765 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGTAO43765 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SGTAO43765 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGTAO43765 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms