Protein–RNA interactions for Protein: O43711

TLX3, T-cell leukemia homeobox protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLX3O43711 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TLX3O43711 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TLX3O43711 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TLX3O43711 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TLX3O43711 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TLX3O43711 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TLX3O43711 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TLX3O43711 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TLX3O43711 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TLX3O43711 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TLX3O43711 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TLX3O43711 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TLX3O43711 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TLX3O43711 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TLX3O43711 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TLX3O43711 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TLX3O43711 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TLX3O43711 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TLX3O43711 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TLX3O43711 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TLX3O43711 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TLX3O43711 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TLX3O43711 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TLX3O43711 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TLX3O43711 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TLX3O43711 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TLX3O43711 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TLX3O43711 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TLX3O43711 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TLX3O43711 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TLX3O43711 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TLX3O43711 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TLX3O43711 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TLX3O43711 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TLX3O43711 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TLX3O43711 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TLX3O43711 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TLX3O43711 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TLX3O43711 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TLX3O43711 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TLX3O43711 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TLX3O43711 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TLX3O43711 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TLX3O43711 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TLX3O43711 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TLX3O43711 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TLX3O43711 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TLX3O43711 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TLX3O43711 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TLX3O43711 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TLX3O43711 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TLX3O43711 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TLX3O43711 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TLX3O43711 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TLX3O43711 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TLX3O43711 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TLX3O43711 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TLX3O43711 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TLX3O43711 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TLX3O43711 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TLX3O43711 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TLX3O43711 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TLX3O43711 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TLX3O43711 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TLX3O43711 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TLX3O43711 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TLX3O43711 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TLX3O43711 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TLX3O43711 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TLX3O43711 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TLX3O43711 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TLX3O43711 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TLX3O43711 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TLX3O43711 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TLX3O43711 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TLX3O43711 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TLX3O43711 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TLX3O43711 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TLX3O43711 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TLX3O43711 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TLX3O43711 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TLX3O43711 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
TLX3O43711 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TLX3O43711 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TLX3O43711 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TLX3O43711 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TLX3O43711 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TLX3O43711 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TLX3O43711 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TLX3O43711 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TLX3O43711 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TLX3O43711 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TLX3O43711 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TLX3O43711 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TLX3O43711 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TLX3O43711 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TLX3O43711 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TLX3O43711 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TLX3O43711 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TLX3O43711 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms