Protein–RNA interactions for Protein: O43615

TIMM44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM44O43615 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TIMM44O43615 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TIMM44O43615 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TIMM44O43615 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TIMM44O43615 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TIMM44O43615 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TIMM44O43615 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TIMM44O43615 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TIMM44O43615 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TIMM44O43615 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TIMM44O43615 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TIMM44O43615 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TIMM44O43615 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TIMM44O43615 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TIMM44O43615 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TIMM44O43615 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TIMM44O43615 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TIMM44O43615 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TIMM44O43615 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TIMM44O43615 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TIMM44O43615 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TIMM44O43615 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TIMM44O43615 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TIMM44O43615 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TIMM44O43615 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TIMM44O43615 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TIMM44O43615 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TIMM44O43615 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TIMM44O43615 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TIMM44O43615 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TIMM44O43615 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TIMM44O43615 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TIMM44O43615 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TIMM44O43615 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TIMM44O43615 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TIMM44O43615 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TIMM44O43615 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TIMM44O43615 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TIMM44O43615 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TIMM44O43615 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TIMM44O43615 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TIMM44O43615 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TIMM44O43615 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TIMM44O43615 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TIMM44O43615 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TIMM44O43615 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TIMM44O43615 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TIMM44O43615 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TIMM44O43615 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TIMM44O43615 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TIMM44O43615 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TIMM44O43615 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TIMM44O43615 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TIMM44O43615 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TIMM44O43615 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TIMM44O43615 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TIMM44O43615 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TIMM44O43615 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TIMM44O43615 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TIMM44O43615 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TIMM44O43615 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TIMM44O43615 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TIMM44O43615 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TIMM44O43615 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TIMM44O43615 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TIMM44O43615 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TIMM44O43615 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TIMM44O43615 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TIMM44O43615 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TIMM44O43615 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TIMM44O43615 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TIMM44O43615 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TIMM44O43615 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TIMM44O43615 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TIMM44O43615 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TIMM44O43615 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TIMM44O43615 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TIMM44O43615 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TIMM44O43615 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TIMM44O43615 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TIMM44O43615 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TIMM44O43615 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TIMM44O43615 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TIMM44O43615 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TIMM44O43615 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TIMM44O43615 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TIMM44O43615 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TIMM44O43615 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TIMM44O43615 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TIMM44O43615 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TIMM44O43615 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TIMM44O43615 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TIMM44O43615 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TIMM44O43615 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TIMM44O43615 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TIMM44O43615 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TIMM44O43615 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TIMM44O43615 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TIMM44O43615 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TIMM44O43615 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms