Protein–RNA interactions for Protein: O43502

RAD51C, DNA repair protein RAD51 homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51CO43502 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAD51CO43502 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAD51CO43502 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RAD51CO43502 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAD51CO43502 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAD51CO43502 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAD51CO43502 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAD51CO43502 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAD51CO43502 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAD51CO43502 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAD51CO43502 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAD51CO43502 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAD51CO43502 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD51CO43502 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD51CO43502 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD51CO43502 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD51CO43502 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD51CO43502 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD51CO43502 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD51CO43502 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD51CO43502 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD51CO43502 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD51CO43502 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD51CO43502 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD51CO43502 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD51CO43502 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAD51CO43502 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAD51CO43502 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAD51CO43502 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAD51CO43502 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAD51CO43502 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RAD51CO43502 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RAD51CO43502 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAD51CO43502 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAD51CO43502 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAD51CO43502 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAD51CO43502 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAD51CO43502 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAD51CO43502 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAD51CO43502 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAD51CO43502 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAD51CO43502 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAD51CO43502 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAD51CO43502 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAD51CO43502 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAD51CO43502 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAD51CO43502 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAD51CO43502 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAD51CO43502 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD51CO43502 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD51CO43502 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD51CO43502 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD51CO43502 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD51CO43502 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD51CO43502 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD51CO43502 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD51CO43502 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD51CO43502 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD51CO43502 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD51CO43502 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD51CO43502 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD51CO43502 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD51CO43502 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD51CO43502 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD51CO43502 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD51CO43502 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD51CO43502 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD51CO43502 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD51CO43502 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD51CO43502 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD51CO43502 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD51CO43502 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD51CO43502 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD51CO43502 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD51CO43502 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD51CO43502 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD51CO43502 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD51CO43502 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD51CO43502 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD51CO43502 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD51CO43502 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD51CO43502 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD51CO43502 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD51CO43502 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD51CO43502 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD51CO43502 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD51CO43502 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD51CO43502 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD51CO43502 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD51CO43502 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD51CO43502 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD51CO43502 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD51CO43502 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD51CO43502 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAD51CO43502 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RAD51CO43502 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAD51CO43502 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAD51CO43502 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAD51CO43502 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAD51CO43502 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms