Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MTSS1O43312 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MTSS1O43312 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MTSS1O43312 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MTSS1O43312 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MTSS1O43312 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MTSS1O43312 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MTSS1O43312 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MTSS1O43312 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MTSS1O43312 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MTSS1O43312 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MTSS1O43312 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MTSS1O43312 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MTSS1O43312 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MTSS1O43312 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MTSS1O43312 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MTSS1O43312 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MTSS1O43312 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MTSS1O43312 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MTSS1O43312 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MTSS1O43312 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MTSS1O43312 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MTSS1O43312 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MTSS1O43312 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MTSS1O43312 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MTSS1O43312 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MTSS1O43312 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MTSS1O43312 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MTSS1O43312 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MTSS1O43312 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTSS1O43312 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTSS1O43312 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTSS1O43312 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTSS1O43312 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTSS1O43312 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTSS1O43312 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTSS1O43312 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTSS1O43312 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTSS1O43312 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTSS1O43312 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTSS1O43312 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTSS1O43312 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTSS1O43312 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MTSS1O43312 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTSS1O43312 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTSS1O43312 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTSS1O43312 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTSS1O43312 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTSS1O43312 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTSS1O43312 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTSS1O43312 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTSS1O43312 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTSS1O43312 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTSS1O43312 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTSS1O43312 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTSS1O43312 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTSS1O43312 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTSS1O43312 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTSS1O43312 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTSS1O43312 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTSS1O43312 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MTSS1O43312 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTSS1O43312 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTSS1O43312 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTSS1O43312 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MTSS1O43312 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MTSS1O43312 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MTSS1O43312 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
MTSS1O43312 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTSS1O43312 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MTSS1O43312 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTSS1O43312 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTSS1O43312 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTSS1O43312 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTSS1O43312 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTSS1O43312 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTSS1O43312 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTSS1O43312 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTSS1O43312 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTSS1O43312 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTSS1O43312 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTSS1O43312 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTSS1O43312 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTSS1O43312 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MTSS1O43312 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTSS1O43312 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MTSS1O43312 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTSS1O43312 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTSS1O43312 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTSS1O43312 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTSS1O43312 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTSS1O43312 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTSS1O43312 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTSS1O43312 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTSS1O43312 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTSS1O43312 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTSS1O43312 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTSS1O43312 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTSS1O43312 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTSS1O43312 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
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