Protein–RNA interactions for Protein: O43280

TREH, Trehalase, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREHO43280 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TREHO43280 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TREHO43280 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TREHO43280 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TREHO43280 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TREHO43280 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TREHO43280 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TREHO43280 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TREHO43280 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TREHO43280 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TREHO43280 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TREHO43280 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TREHO43280 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TREHO43280 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TREHO43280 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TREHO43280 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TREHO43280 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TREHO43280 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TREHO43280 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TREHO43280 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TREHO43280 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TREHO43280 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TREHO43280 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TREHO43280 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TREHO43280 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TREHO43280 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TREHO43280 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TREHO43280 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TREHO43280 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TREHO43280 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TREHO43280 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TREHO43280 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TREHO43280 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TREHO43280 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TREHO43280 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TREHO43280 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TREHO43280 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TREHO43280 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TREHO43280 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TREHO43280 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TREHO43280 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TREHO43280 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TREHO43280 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TREHO43280 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TREHO43280 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TREHO43280 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TREHO43280 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TREHO43280 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TREHO43280 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TREHO43280 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TREHO43280 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TREHO43280 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TREHO43280 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TREHO43280 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TREHO43280 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TREHO43280 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TREHO43280 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TREHO43280 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TREHO43280 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TREHO43280 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TREHO43280 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TREHO43280 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TREHO43280 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TREHO43280 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TREHO43280 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TREHO43280 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TREHO43280 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TREHO43280 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TREHO43280 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TREHO43280 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TREHO43280 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TREHO43280 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TREHO43280 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TREHO43280 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TREHO43280 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TREHO43280 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TREHO43280 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TREHO43280 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TREHO43280 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TREHO43280 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TREHO43280 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TREHO43280 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TREHO43280 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TREHO43280 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TREHO43280 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TREHO43280 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TREHO43280 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TREHO43280 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TREHO43280 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TREHO43280 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TREHO43280 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TREHO43280 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TREHO43280 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TREHO43280 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TREHO43280 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TREHO43280 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TREHO43280 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TREHO43280 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TREHO43280 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TREHO43280 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms