Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDUFS4O43181 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDUFS4O43181 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDUFS4O43181 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDUFS4O43181 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDUFS4O43181 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDUFS4O43181 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDUFS4O43181 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NDUFS4O43181 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDUFS4O43181 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDUFS4O43181 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDUFS4O43181 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDUFS4O43181 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDUFS4O43181 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDUFS4O43181 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDUFS4O43181 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
NDUFS4O43181 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NDUFS4O43181 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDUFS4O43181 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDUFS4O43181 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDUFS4O43181 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDUFS4O43181 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDUFS4O43181 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDUFS4O43181 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDUFS4O43181 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDUFS4O43181 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDUFS4O43181 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NDUFS4O43181 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDUFS4O43181 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDUFS4O43181 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDUFS4O43181 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDUFS4O43181 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDUFS4O43181 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDUFS4O43181 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDUFS4O43181 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDUFS4O43181 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDUFS4O43181 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDUFS4O43181 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDUFS4O43181 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDUFS4O43181 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDUFS4O43181 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDUFS4O43181 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDUFS4O43181 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDUFS4O43181 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDUFS4O43181 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDUFS4O43181 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDUFS4O43181 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDUFS4O43181 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDUFS4O43181 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDUFS4O43181 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDUFS4O43181 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDUFS4O43181 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDUFS4O43181 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDUFS4O43181 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDUFS4O43181 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDUFS4O43181 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDUFS4O43181 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDUFS4O43181 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDUFS4O43181 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDUFS4O43181 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDUFS4O43181 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NDUFS4O43181 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDUFS4O43181 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDUFS4O43181 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDUFS4O43181 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDUFS4O43181 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDUFS4O43181 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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NDUFS4O43181 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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NDUFS4O43181 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDUFS4O43181 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NDUFS4O43181 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDUFS4O43181 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDUFS4O43181 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDUFS4O43181 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFS4O43181 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFS4O43181 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFS4O43181 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFS4O43181 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFS4O43181 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFS4O43181 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFS4O43181 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFS4O43181 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFS4O43181 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFS4O43181 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFS4O43181 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFS4O43181 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFS4O43181 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFS4O43181 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFS4O43181 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFS4O43181 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFS4O43181 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NDUFS4O43181 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NDUFS4O43181 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NDUFS4O43181 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NDUFS4O43181 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDUFS4O43181 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDUFS4O43181 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDUFS4O43181 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
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