Protein–RNA interactions for Protein: O15544

LINC01565, Protein GR6, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01565O15544 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC01565O15544 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC01565O15544 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC01565O15544 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC01565O15544 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC01565O15544 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC01565O15544 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINC01565O15544 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINC01565O15544 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINC01565O15544 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINC01565O15544 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINC01565O15544 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINC01565O15544 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINC01565O15544 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINC01565O15544 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINC01565O15544 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINC01565O15544 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LINC01565O15544 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LINC01565O15544 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LINC01565O15544 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LINC01565O15544 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LINC01565O15544 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LINC01565O15544 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LINC01565O15544 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LINC01565O15544 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LINC01565O15544 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LINC01565O15544 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LINC01565O15544 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LINC01565O15544 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LINC01565O15544 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LINC01565O15544 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LINC01565O15544 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LINC01565O15544 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINC01565O15544 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINC01565O15544 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINC01565O15544 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINC01565O15544 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINC01565O15544 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LINC01565O15544 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINC01565O15544 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINC01565O15544 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINC01565O15544 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LINC01565O15544 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LINC01565O15544 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINC01565O15544 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINC01565O15544 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINC01565O15544 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC01565O15544 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC01565O15544 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC01565O15544 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC01565O15544 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC01565O15544 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC01565O15544 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC01565O15544 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC01565O15544 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC01565O15544 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC01565O15544 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC01565O15544 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC01565O15544 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC01565O15544 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC01565O15544 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC01565O15544 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC01565O15544 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC01565O15544 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC01565O15544 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC01565O15544 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC01565O15544 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINC01565O15544 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINC01565O15544 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINC01565O15544 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINC01565O15544 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC01565O15544 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC01565O15544 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC01565O15544 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC01565O15544 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC01565O15544 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC01565O15544 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC01565O15544 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC01565O15544 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC01565O15544 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC01565O15544 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC01565O15544 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC01565O15544 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC01565O15544 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC01565O15544 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC01565O15544 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LINC01565O15544 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LINC01565O15544 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LINC01565O15544 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LINC01565O15544 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LINC01565O15544 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINC01565O15544 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINC01565O15544 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINC01565O15544 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINC01565O15544 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINC01565O15544 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINC01565O15544 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINC01565O15544 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINC01565O15544 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINC01565O15544 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms