Protein–RNA interactions for Protein: O14901

KLF11, Krueppel-like factor 11, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF11O14901 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLF11O14901 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLF11O14901 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLF11O14901 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLF11O14901 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLF11O14901 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLF11O14901 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLF11O14901 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLF11O14901 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLF11O14901 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLF11O14901 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLF11O14901 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLF11O14901 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KLF11O14901 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLF11O14901 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLF11O14901 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KLF11O14901 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLF11O14901 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KLF11O14901 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLF11O14901 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLF11O14901 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLF11O14901 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLF11O14901 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLF11O14901 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLF11O14901 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLF11O14901 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLF11O14901 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLF11O14901 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLF11O14901 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLF11O14901 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLF11O14901 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KLF11O14901 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLF11O14901 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLF11O14901 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLF11O14901 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLF11O14901 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLF11O14901 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLF11O14901 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLF11O14901 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLF11O14901 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLF11O14901 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLF11O14901 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLF11O14901 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLF11O14901 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLF11O14901 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLF11O14901 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLF11O14901 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLF11O14901 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLF11O14901 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLF11O14901 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLF11O14901 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLF11O14901 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLF11O14901 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLF11O14901 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLF11O14901 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLF11O14901 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLF11O14901 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KLF11O14901 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KLF11O14901 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KLF11O14901 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLF11O14901 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLF11O14901 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLF11O14901 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KLF11O14901 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KLF11O14901 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLF11O14901 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLF11O14901 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KLF11O14901 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLF11O14901 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLF11O14901 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLF11O14901 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLF11O14901 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLF11O14901 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLF11O14901 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLF11O14901 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLF11O14901 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLF11O14901 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLF11O14901 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLF11O14901 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLF11O14901 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLF11O14901 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLF11O14901 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLF11O14901 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KLF11O14901 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLF11O14901 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLF11O14901 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLF11O14901 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KLF11O14901 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLF11O14901 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLF11O14901 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLF11O14901 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLF11O14901 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KLF11O14901 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLF11O14901 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLF11O14901 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLF11O14901 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLF11O14901 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLF11O14901 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLF11O14901 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLF11O14901 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms