Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHOX2AO14813 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms