Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EBAG9O00559 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EBAG9O00559 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EBAG9O00559 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
EBAG9O00559 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EBAG9O00559 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EBAG9O00559 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EBAG9O00559 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
EBAG9O00559 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EBAG9O00559 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EBAG9O00559 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EBAG9O00559 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EBAG9O00559 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EBAG9O00559 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EBAG9O00559 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EBAG9O00559 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EBAG9O00559 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EBAG9O00559 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EBAG9O00559 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EBAG9O00559 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EBAG9O00559 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EBAG9O00559 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EBAG9O00559 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EBAG9O00559 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EBAG9O00559 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EBAG9O00559 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EBAG9O00559 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EBAG9O00559 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EBAG9O00559 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EBAG9O00559 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EBAG9O00559 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EBAG9O00559 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EBAG9O00559 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EBAG9O00559 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EBAG9O00559 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EBAG9O00559 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EBAG9O00559 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EBAG9O00559 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EBAG9O00559 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EBAG9O00559 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EBAG9O00559 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EBAG9O00559 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EBAG9O00559 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EBAG9O00559 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EBAG9O00559 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
EBAG9O00559 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EBAG9O00559 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EBAG9O00559 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EBAG9O00559 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EBAG9O00559 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EBAG9O00559 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EBAG9O00559 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EBAG9O00559 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EBAG9O00559 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EBAG9O00559 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EBAG9O00559 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EBAG9O00559 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EBAG9O00559 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EBAG9O00559 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EBAG9O00559 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EBAG9O00559 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EBAG9O00559 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EBAG9O00559 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EBAG9O00559 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EBAG9O00559 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EBAG9O00559 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EBAG9O00559 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EBAG9O00559 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EBAG9O00559 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EBAG9O00559 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EBAG9O00559 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EBAG9O00559 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EBAG9O00559 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EBAG9O00559 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EBAG9O00559 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EBAG9O00559 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EBAG9O00559 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EBAG9O00559 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EBAG9O00559 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EBAG9O00559 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EBAG9O00559 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EBAG9O00559 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EBAG9O00559 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EBAG9O00559 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EBAG9O00559 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EBAG9O00559 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EBAG9O00559 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EBAG9O00559 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EBAG9O00559 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EBAG9O00559 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EBAG9O00559 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EBAG9O00559 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EBAG9O00559 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EBAG9O00559 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EBAG9O00559 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EBAG9O00559 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EBAG9O00559 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EBAG9O00559 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EBAG9O00559 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EBAG9O00559 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms