Protein–RNA interactions for Protein: O00505

KPNA3, Importin subunit alpha-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA3O00505 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KPNA3O00505 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KPNA3O00505 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KPNA3O00505 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KPNA3O00505 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KPNA3O00505 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KPNA3O00505 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KPNA3O00505 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KPNA3O00505 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KPNA3O00505 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KPNA3O00505 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KPNA3O00505 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KPNA3O00505 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KPNA3O00505 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KPNA3O00505 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KPNA3O00505 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KPNA3O00505 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KPNA3O00505 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KPNA3O00505 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KPNA3O00505 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KPNA3O00505 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KPNA3O00505 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KPNA3O00505 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KPNA3O00505 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KPNA3O00505 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KPNA3O00505 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KPNA3O00505 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KPNA3O00505 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KPNA3O00505 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KPNA3O00505 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KPNA3O00505 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KPNA3O00505 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KPNA3O00505 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KPNA3O00505 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KPNA3O00505 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KPNA3O00505 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KPNA3O00505 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KPNA3O00505 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KPNA3O00505 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KPNA3O00505 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KPNA3O00505 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KPNA3O00505 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KPNA3O00505 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KPNA3O00505 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KPNA3O00505 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KPNA3O00505 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KPNA3O00505 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KPNA3O00505 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KPNA3O00505 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KPNA3O00505 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KPNA3O00505 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KPNA3O00505 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KPNA3O00505 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KPNA3O00505 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KPNA3O00505 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KPNA3O00505 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KPNA3O00505 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KPNA3O00505 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KPNA3O00505 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KPNA3O00505 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KPNA3O00505 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KPNA3O00505 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KPNA3O00505 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KPNA3O00505 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KPNA3O00505 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KPNA3O00505 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KPNA3O00505 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KPNA3O00505 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KPNA3O00505 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KPNA3O00505 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KPNA3O00505 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KPNA3O00505 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KPNA3O00505 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KPNA3O00505 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KPNA3O00505 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
KPNA3O00505 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KPNA3O00505 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KPNA3O00505 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KPNA3O00505 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KPNA3O00505 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KPNA3O00505 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KPNA3O00505 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KPNA3O00505 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KPNA3O00505 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KPNA3O00505 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KPNA3O00505 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KPNA3O00505 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KPNA3O00505 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KPNA3O00505 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KPNA3O00505 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KPNA3O00505 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KPNA3O00505 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KPNA3O00505 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KPNA3O00505 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KPNA3O00505 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KPNA3O00505 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KPNA3O00505 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KPNA3O00505 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KPNA3O00505 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KPNA3O00505 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms