Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBXN8O00124 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBXN8O00124 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
UBXN8O00124 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBXN8O00124 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBXN8O00124 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBXN8O00124 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBXN8O00124 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBXN8O00124 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UBXN8O00124 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UBXN8O00124 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBXN8O00124 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBXN8O00124 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBXN8O00124 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBXN8O00124 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBXN8O00124 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
UBXN8O00124 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBXN8O00124 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBXN8O00124 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBXN8O00124 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBXN8O00124 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBXN8O00124 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBXN8O00124 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBXN8O00124 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBXN8O00124 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBXN8O00124 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBXN8O00124 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBXN8O00124 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBXN8O00124 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBXN8O00124 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBXN8O00124 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBXN8O00124 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBXN8O00124 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBXN8O00124 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBXN8O00124 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBXN8O00124 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBXN8O00124 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBXN8O00124 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
UBXN8O00124 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBXN8O00124 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
UBXN8O00124 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBXN8O00124 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBXN8O00124 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBXN8O00124 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBXN8O00124 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBXN8O00124 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBXN8O00124 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBXN8O00124 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBXN8O00124 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBXN8O00124 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBXN8O00124 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBXN8O00124 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBXN8O00124 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBXN8O00124 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBXN8O00124 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBXN8O00124 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBXN8O00124 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBXN8O00124 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBXN8O00124 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBXN8O00124 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBXN8O00124 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBXN8O00124 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBXN8O00124 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBXN8O00124 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBXN8O00124 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBXN8O00124 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBXN8O00124 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBXN8O00124 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBXN8O00124 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBXN8O00124 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBXN8O00124 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBXN8O00124 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBXN8O00124 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBXN8O00124 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBXN8O00124 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBXN8O00124 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBXN8O00124 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBXN8O00124 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
UBXN8O00124 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBXN8O00124 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBXN8O00124 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBXN8O00124 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBXN8O00124 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBXN8O00124 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBXN8O00124 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBXN8O00124 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBXN8O00124 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBXN8O00124 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBXN8O00124 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBXN8O00124 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBXN8O00124 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBXN8O00124 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBXN8O00124 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBXN8O00124 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBXN8O00124 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBXN8O00124 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBXN8O00124 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBXN8O00124 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
UBXN8O00124 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBXN8O00124 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms