Protein–RNA interactions for Protein: J3QKU1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QKU1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
J3QKU1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
J3QKU1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
J3QKU1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
J3QKU1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
J3QKU1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
J3QKU1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3QKU1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3QKU1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3QKU1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3QKU1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3QKU1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3QKU1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3QKU1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3QKU1 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3QKU1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3QKU1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3QKU1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3QKU1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3QKU1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3QKU1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3QKU1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3QKU1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3QKU1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3QKU1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
J3QKU1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
J3QKU1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
J3QKU1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
J3QKU1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
J3QKU1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
J3QKU1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
J3QKU1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
J3QKU1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
J3QKU1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
J3QKU1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
J3QKU1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
J3QKU1 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
J3QKU1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
J3QKU1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
J3QKU1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
J3QKU1 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
J3QKU1 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
J3QKU1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
J3QKU1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
J3QKU1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
J3QKU1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
J3QKU1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
J3QKU1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
J3QKU1 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
J3QKU1 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
J3QKU1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
J3QKU1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
J3QKU1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
J3QKU1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
J3QKU1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
J3QKU1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
J3QKU1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
J3QKU1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
J3QKU1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
J3QKU1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
J3QKU1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
J3QKU1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
J3QKU1 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
J3QKU1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
J3QKU1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
J3QKU1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
J3QKU1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
J3QKU1 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
J3QKU1 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
J3QKU1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
J3QKU1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
J3QKU1 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
J3QKU1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
J3QKU1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
J3QKU1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
J3QKU1 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
J3QKU1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
J3QKU1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
J3QKU1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
J3QKU1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
J3QKU1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
J3QKU1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
J3QKU1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
J3QKU1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
J3QKU1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
J3QKU1 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20■□□□□ 0.79
J3QKU1 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
J3QKU1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
J3QKU1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
J3QKU1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
J3QKU1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
J3QKU1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
J3QKU1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
J3QKU1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
J3QKU1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
J3QKU1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
J3QKU1 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
J3QKU1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
J3QKU1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
J3QKU1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms