Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms