Protein–RNA interactions for Protein: F8WBC2

INMT-MINDY4, INMT-MINDY4 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INMT-MINDY4F8WBC2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
INMT-MINDY4F8WBC2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
INMT-MINDY4F8WBC2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
INMT-MINDY4F8WBC2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
INMT-MINDY4F8WBC2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
INMT-MINDY4F8WBC2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
INMT-MINDY4F8WBC2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
INMT-MINDY4F8WBC2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
INMT-MINDY4F8WBC2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
INMT-MINDY4F8WBC2 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
INMT-MINDY4F8WBC2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
INMT-MINDY4F8WBC2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
INMT-MINDY4F8WBC2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
INMT-MINDY4F8WBC2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
INMT-MINDY4F8WBC2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
INMT-MINDY4F8WBC2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
INMT-MINDY4F8WBC2 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
INMT-MINDY4F8WBC2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
INMT-MINDY4F8WBC2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
INMT-MINDY4F8WBC2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
INMT-MINDY4F8WBC2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
INMT-MINDY4F8WBC2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
INMT-MINDY4F8WBC2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
INMT-MINDY4F8WBC2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
INMT-MINDY4F8WBC2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
INMT-MINDY4F8WBC2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
INMT-MINDY4F8WBC2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
INMT-MINDY4F8WBC2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
INMT-MINDY4F8WBC2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
INMT-MINDY4F8WBC2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
INMT-MINDY4F8WBC2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
INMT-MINDY4F8WBC2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
INMT-MINDY4F8WBC2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
INMT-MINDY4F8WBC2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
INMT-MINDY4F8WBC2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
INMT-MINDY4F8WBC2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
INMT-MINDY4F8WBC2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
INMT-MINDY4F8WBC2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
INMT-MINDY4F8WBC2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
INMT-MINDY4F8WBC2 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
INMT-MINDY4F8WBC2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
INMT-MINDY4F8WBC2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
INMT-MINDY4F8WBC2 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
INMT-MINDY4F8WBC2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
INMT-MINDY4F8WBC2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
INMT-MINDY4F8WBC2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
INMT-MINDY4F8WBC2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
INMT-MINDY4F8WBC2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
INMT-MINDY4F8WBC2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
INMT-MINDY4F8WBC2 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
INMT-MINDY4F8WBC2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
INMT-MINDY4F8WBC2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
INMT-MINDY4F8WBC2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
INMT-MINDY4F8WBC2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
INMT-MINDY4F8WBC2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
INMT-MINDY4F8WBC2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
INMT-MINDY4F8WBC2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
INMT-MINDY4F8WBC2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
INMT-MINDY4F8WBC2 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
INMT-MINDY4F8WBC2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
INMT-MINDY4F8WBC2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
INMT-MINDY4F8WBC2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
INMT-MINDY4F8WBC2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
INMT-MINDY4F8WBC2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
INMT-MINDY4F8WBC2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
INMT-MINDY4F8WBC2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
INMT-MINDY4F8WBC2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
INMT-MINDY4F8WBC2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
INMT-MINDY4F8WBC2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
INMT-MINDY4F8WBC2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
INMT-MINDY4F8WBC2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
INMT-MINDY4F8WBC2 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
INMT-MINDY4F8WBC2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
INMT-MINDY4F8WBC2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
INMT-MINDY4F8WBC2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
INMT-MINDY4F8WBC2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
INMT-MINDY4F8WBC2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
INMT-MINDY4F8WBC2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
INMT-MINDY4F8WBC2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
INMT-MINDY4F8WBC2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
INMT-MINDY4F8WBC2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
INMT-MINDY4F8WBC2 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
INMT-MINDY4F8WBC2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
INMT-MINDY4F8WBC2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
INMT-MINDY4F8WBC2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
INMT-MINDY4F8WBC2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
INMT-MINDY4F8WBC2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
INMT-MINDY4F8WBC2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
INMT-MINDY4F8WBC2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
INMT-MINDY4F8WBC2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
INMT-MINDY4F8WBC2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
INMT-MINDY4F8WBC2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
INMT-MINDY4F8WBC2 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
INMT-MINDY4F8WBC2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
INMT-MINDY4F8WBC2 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
INMT-MINDY4F8WBC2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
INMT-MINDY4F8WBC2 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
INMT-MINDY4F8WBC2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
INMT-MINDY4F8WBC2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
INMT-MINDY4F8WBC2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms