Protein–RNA interactions for Protein: C9IYK1

Gap junction protein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9IYK1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C9IYK1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C9IYK1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C9IYK1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C9IYK1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C9IYK1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C9IYK1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C9IYK1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C9IYK1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C9IYK1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C9IYK1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C9IYK1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C9IYK1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C9IYK1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C9IYK1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C9IYK1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C9IYK1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C9IYK1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C9IYK1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C9IYK1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C9IYK1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
C9IYK1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C9IYK1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C9IYK1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
C9IYK1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C9IYK1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C9IYK1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C9IYK1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C9IYK1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C9IYK1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C9IYK1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C9IYK1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C9IYK1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C9IYK1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C9IYK1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C9IYK1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C9IYK1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C9IYK1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
C9IYK1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
C9IYK1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C9IYK1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C9IYK1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C9IYK1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C9IYK1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C9IYK1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C9IYK1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C9IYK1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C9IYK1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C9IYK1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C9IYK1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C9IYK1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C9IYK1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C9IYK1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C9IYK1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
C9IYK1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C9IYK1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
C9IYK1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C9IYK1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
C9IYK1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
C9IYK1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
C9IYK1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C9IYK1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C9IYK1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C9IYK1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C9IYK1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C9IYK1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C9IYK1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C9IYK1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C9IYK1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C9IYK1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C9IYK1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C9IYK1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C9IYK1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C9IYK1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C9IYK1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C9IYK1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C9IYK1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C9IYK1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
C9IYK1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C9IYK1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C9IYK1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C9IYK1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
C9IYK1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C9IYK1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C9IYK1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C9IYK1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C9IYK1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C9IYK1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C9IYK1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C9IYK1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C9IYK1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C9IYK1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C9IYK1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C9IYK1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C9IYK1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C9IYK1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C9IYK1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C9IYK1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
C9IYK1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C9IYK1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms