Protein–RNA interactions for Protein: B4E171

Tetraspanin, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E171 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
B4E171 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
B4E171 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
B4E171 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
B4E171 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
B4E171 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
B4E171 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
B4E171 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
B4E171 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
B4E171 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
B4E171 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
B4E171 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
B4E171 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
B4E171 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
B4E171 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
B4E171 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
B4E171 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
B4E171 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
B4E171 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
B4E171 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
B4E171 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
B4E171 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
B4E171 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
B4E171 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
B4E171 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
B4E171 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
B4E171 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
B4E171 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
B4E171 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
B4E171 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
B4E171 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
B4E171 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
B4E171 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
B4E171 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
B4E171 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
B4E171 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
B4E171 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
B4E171 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
B4E171 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
B4E171 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
B4E171 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
B4E171 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
B4E171 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
B4E171 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
B4E171 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
B4E171 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
B4E171 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
B4E171 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
B4E171 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
B4E171 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
B4E171 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
B4E171 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
B4E171 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
B4E171 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
B4E171 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
B4E171 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
B4E171 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
B4E171 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
B4E171 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
B4E171 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
B4E171 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
B4E171 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
B4E171 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
B4E171 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
B4E171 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
B4E171 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
B4E171 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
B4E171 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
B4E171 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
B4E171 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
B4E171 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
B4E171 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
B4E171 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
B4E171 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
B4E171 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
B4E171 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
B4E171 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
B4E171 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
B4E171 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
B4E171 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
B4E171 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
B4E171 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
B4E171 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
B4E171 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
B4E171 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
B4E171 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
B4E171 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
B4E171 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
B4E171 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
B4E171 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
B4E171 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
B4E171 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
B4E171 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
B4E171 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
B4E171 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
B4E171 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
B4E171 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
B4E171 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
B4E171 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
B4E171 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms