Protein–RNA interactions for Protein: A6NCQ9

RNF222, RING finger protein 222, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF222A6NCQ9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RNF222A6NCQ9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RNF222A6NCQ9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RNF222A6NCQ9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RNF222A6NCQ9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RNF222A6NCQ9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RNF222A6NCQ9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RNF222A6NCQ9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RNF222A6NCQ9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RNF222A6NCQ9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RNF222A6NCQ9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RNF222A6NCQ9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RNF222A6NCQ9 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RNF222A6NCQ9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RNF222A6NCQ9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RNF222A6NCQ9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF222A6NCQ9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF222A6NCQ9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF222A6NCQ9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF222A6NCQ9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF222A6NCQ9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF222A6NCQ9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF222A6NCQ9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF222A6NCQ9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF222A6NCQ9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF222A6NCQ9 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF222A6NCQ9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF222A6NCQ9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF222A6NCQ9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF222A6NCQ9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF222A6NCQ9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF222A6NCQ9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF222A6NCQ9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF222A6NCQ9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF222A6NCQ9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF222A6NCQ9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF222A6NCQ9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF222A6NCQ9 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF222A6NCQ9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF222A6NCQ9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF222A6NCQ9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF222A6NCQ9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF222A6NCQ9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF222A6NCQ9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF222A6NCQ9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF222A6NCQ9 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF222A6NCQ9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF222A6NCQ9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF222A6NCQ9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF222A6NCQ9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF222A6NCQ9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF222A6NCQ9 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF222A6NCQ9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF222A6NCQ9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF222A6NCQ9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF222A6NCQ9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF222A6NCQ9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF222A6NCQ9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF222A6NCQ9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF222A6NCQ9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF222A6NCQ9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF222A6NCQ9 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF222A6NCQ9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF222A6NCQ9 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF222A6NCQ9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF222A6NCQ9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF222A6NCQ9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF222A6NCQ9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF222A6NCQ9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF222A6NCQ9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF222A6NCQ9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF222A6NCQ9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF222A6NCQ9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF222A6NCQ9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF222A6NCQ9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF222A6NCQ9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF222A6NCQ9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF222A6NCQ9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF222A6NCQ9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF222A6NCQ9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF222A6NCQ9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF222A6NCQ9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF222A6NCQ9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF222A6NCQ9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF222A6NCQ9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF222A6NCQ9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF222A6NCQ9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
RNF222A6NCQ9 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF222A6NCQ9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF222A6NCQ9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF222A6NCQ9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF222A6NCQ9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF222A6NCQ9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF222A6NCQ9 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF222A6NCQ9 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF222A6NCQ9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF222A6NCQ9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF222A6NCQ9 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF222A6NCQ9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF222A6NCQ9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms