Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
IRGMA1A4Y4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IRGMA1A4Y4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IRGMA1A4Y4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IRGMA1A4Y4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
IRGMA1A4Y4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IRGMA1A4Y4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IRGMA1A4Y4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IRGMA1A4Y4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IRGMA1A4Y4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IRGMA1A4Y4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IRGMA1A4Y4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IRGMA1A4Y4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IRGMA1A4Y4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms