Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PPC1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PPC1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A1W2PPC1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A1W2PPC1 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A1W2PPC1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A1W2PPC1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A1W2PPC1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
A0A1W2PPC1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
A0A1W2PPC1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC1 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC1 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A1W2PPC1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC1 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC1 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC1 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A1W2PPC1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms