Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQJ8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQJ8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A0U1RQJ8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A0U1RQJ8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A0U1RQJ8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A0U1RQJ8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A0U1RQJ8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A0U1RQJ8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A0U1RQJ8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A0U1RQJ8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A0U1RQJ8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A0U1RQJ8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A0U1RQJ8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A0U1RQJ8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A0U1RQJ8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A0U1RQJ8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A0U1RQJ8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A0U1RQJ8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A0U1RQJ8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A0U1RQJ8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A0U1RQJ8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A0U1RQJ8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A0U1RQJ8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A0U1RQJ8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A0U1RQJ8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A0U1RQJ8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A0U1RQJ8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A0U1RQJ8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A0U1RQJ8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A0U1RQJ8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A0U1RQJ8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A0U1RQJ8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A0U1RQJ8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A0U1RQJ8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A0U1RQJ8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A0U1RQJ8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A0U1RQJ8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A0U1RQJ8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A0U1RQJ8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A0U1RQJ8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A0U1RQJ8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A0U1RQJ8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A0U1RQJ8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A0U1RQJ8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A0U1RQJ8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A0U1RQJ8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A0U1RQJ8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A0U1RQJ8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A0U1RQJ8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A0U1RQJ8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A0A0U1RQJ8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24■■□□□ 1.43
A0A0U1RQJ8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A0A0U1RQJ8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
A0A0U1RQJ8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A0A0U1RQJ8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A0A0U1RQJ8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
A0A0U1RQJ8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
A0A0U1RQJ8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
A0A0U1RQJ8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
A0A0U1RQJ8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
A0A0U1RQJ8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A0A0U1RQJ8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A0A0U1RQJ8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
A0A0U1RQJ8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
A0A0U1RQJ8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
A0A0U1RQJ8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
A0A0U1RQJ8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
A0A0U1RQJ8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A0U1RQJ8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A0U1RQJ8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A0U1RQJ8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A0U1RQJ8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A0U1RQJ8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A0U1RQJ8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A0U1RQJ8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A0U1RQJ8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A0U1RQJ8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A0U1RQJ8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
A0A0U1RQJ8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
A0A0U1RQJ8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
A0A0U1RQJ8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
A0A0U1RQJ8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
A0A0U1RQJ8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
A0A0U1RQJ8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
A0A0U1RQJ8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
A0A0U1RQJ8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A0U1RQJ8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A0U1RQJ8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A0U1RQJ8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A0U1RQJ8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A0U1RQJ8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A0U1RQJ8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A0U1RQJ8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
A0A0U1RQJ8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
A0A0U1RQJ8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A0U1RQJ8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A0U1RQJ8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A0U1RQJ8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A0U1RQJ8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A0U1RQJ8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A0U1RQJ8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.9 ms