Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G9

Cldn3, Claudin-3, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn3Q9Z0G9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cldn3Q9Z0G9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cldn3Q9Z0G9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cldn3Q9Z0G9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cldn3Q9Z0G9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cldn3Q9Z0G9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cldn3Q9Z0G9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cldn3Q9Z0G9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cldn3Q9Z0G9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cldn3Q9Z0G9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Cldn3Q9Z0G9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cldn3Q9Z0G9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cldn3Q9Z0G9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cldn3Q9Z0G9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cldn3Q9Z0G9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cldn3Q9Z0G9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cldn3Q9Z0G9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cldn3Q9Z0G9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cldn3Q9Z0G9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cldn3Q9Z0G9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cldn3Q9Z0G9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cldn3Q9Z0G9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cldn3Q9Z0G9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Cldn3Q9Z0G9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cldn3Q9Z0G9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cldn3Q9Z0G9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cldn3Q9Z0G9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Cldn3Q9Z0G9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cldn3Q9Z0G9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cldn3Q9Z0G9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cldn3Q9Z0G9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cldn3Q9Z0G9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cldn3Q9Z0G9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cldn3Q9Z0G9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cldn3Q9Z0G9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cldn3Q9Z0G9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cldn3Q9Z0G9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cldn3Q9Z0G9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cldn3Q9Z0G9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Cldn3Q9Z0G9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cldn3Q9Z0G9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cldn3Q9Z0G9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cldn3Q9Z0G9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cldn3Q9Z0G9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cldn3Q9Z0G9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cldn3Q9Z0G9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cldn3Q9Z0G9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cldn3Q9Z0G9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cldn3Q9Z0G9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cldn3Q9Z0G9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cldn3Q9Z0G9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cldn3Q9Z0G9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cldn3Q9Z0G9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cldn3Q9Z0G9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cldn3Q9Z0G9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cldn3Q9Z0G9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cldn3Q9Z0G9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cldn3Q9Z0G9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cldn3Q9Z0G9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cldn3Q9Z0G9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cldn3Q9Z0G9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cldn3Q9Z0G9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cldn3Q9Z0G9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cldn3Q9Z0G9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cldn3Q9Z0G9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cldn3Q9Z0G9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cldn3Q9Z0G9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cldn3Q9Z0G9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cldn3Q9Z0G9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cldn3Q9Z0G9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cldn3Q9Z0G9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cldn3Q9Z0G9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cldn3Q9Z0G9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Cldn3Q9Z0G9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cldn3Q9Z0G9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cldn3Q9Z0G9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Cldn3Q9Z0G9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cldn3Q9Z0G9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cldn3Q9Z0G9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cldn3Q9Z0G9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cldn3Q9Z0G9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cldn3Q9Z0G9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cldn3Q9Z0G9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cldn3Q9Z0G9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cldn3Q9Z0G9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cldn3Q9Z0G9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cldn3Q9Z0G9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cldn3Q9Z0G9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cldn3Q9Z0G9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cldn3Q9Z0G9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cldn3Q9Z0G9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cldn3Q9Z0G9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cldn3Q9Z0G9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cldn3Q9Z0G9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cldn3Q9Z0G9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cldn3Q9Z0G9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cldn3Q9Z0G9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Cldn3Q9Z0G9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cldn3Q9Z0G9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Cldn3Q9Z0G9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms