Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Sema6cQ9WTM3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Sema6cQ9WTM3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24,73■■□□□ 1,55
Sema6cQ9WTM3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Sema6cQ9WTM3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
Sema6cQ9WTM3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,54
Sema6cQ9WTM3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24,68■■□□□ 1,54
Sema6cQ9WTM3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
Sema6cQ9WTM3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
Sema6cQ9WTM3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24,66■■□□□ 1,54
Sema6cQ9WTM3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,53
Sema6cQ9WTM3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24,63■■□□□ 1,53
Sema6cQ9WTM3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,63■■□□□ 1,53
Sema6cQ9WTM3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
Sema6cQ9WTM3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
Sema6cQ9WTM3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,59■■□□□ 1,53
Sema6cQ9WTM3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,53
Sema6cQ9WTM3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24,58■■□□□ 1,53
Sema6cQ9WTM3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,53
Sema6cQ9WTM3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Sema6cQ9WTM3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Sema6cQ9WTM3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Sema6cQ9WTM3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
Sema6cQ9WTM3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24,52■■□□□ 1,52
Sema6cQ9WTM3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
Sema6cQ9WTM3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
Sema6cQ9WTM3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
Sema6cQ9WTM3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,48■■□□□ 1,51
Sema6cQ9WTM3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24,48■■□□□ 1,51
Sema6cQ9WTM3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
Sema6cQ9WTM3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,46■■□□□ 1,51
Sema6cQ9WTM3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,5
Sema6cQ9WTM3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,5
Sema6cQ9WTM3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24,43■■□□□ 1,5
Sema6cQ9WTM3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24,43■■□□□ 1,5
Sema6cQ9WTM3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24,43■■□□□ 1,5
Sema6cQ9WTM3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24,42■■□□□ 1,5
Sema6cQ9WTM3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
Sema6cQ9WTM3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24,42■■□□□ 1,5
Sema6cQ9WTM3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24,42■■□□□ 1,5
Sema6cQ9WTM3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
Sema6cQ9WTM3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,38■■□□□ 1,49
Sema6cQ9WTM3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,37■■□□□ 1,49
Sema6cQ9WTM3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,37■■□□□ 1,49
Sema6cQ9WTM3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24,35■■□□□ 1,49
Sema6cQ9WTM3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
Sema6cQ9WTM3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24,35■■□□□ 1,49
Sema6cQ9WTM3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
Sema6cQ9WTM3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,35■■□□□ 1,49
Sema6cQ9WTM3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,49
Sema6cQ9WTM3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,49
Sema6cQ9WTM3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,49
Sema6cQ9WTM3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,33■■□□□ 1,49
Sema6cQ9WTM3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24,28■■□□□ 1,48
Sema6cQ9WTM3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,27■■□□□ 1,48
Sema6cQ9WTM3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,26■■□□□ 1,47
Sema6cQ9WTM3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24,26■■□□□ 1,47
Sema6cQ9WTM3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24,25■■□□□ 1,47
Sema6cQ9WTM3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,24■■□□□ 1,47
Sema6cQ9WTM3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,23■■□□□ 1,47
Sema6cQ9WTM3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,23■■□□□ 1,47
Sema6cQ9WTM3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24,23■■□□□ 1,47
Sema6cQ9WTM3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24,2■■□□□ 1,46
Sema6cQ9WTM3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24,18■■□□□ 1,46
Sema6cQ9WTM3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24,18■■□□□ 1,46
Sema6cQ9WTM3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
Sema6cQ9WTM3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
Sema6cQ9WTM3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
Sema6cQ9WTM3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
Sema6cQ9WTM3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,14■■□□□ 1,46
Sema6cQ9WTM3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24,14■■□□□ 1,45
Sema6cQ9WTM3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,14■■□□□ 1,45
Sema6cQ9WTM3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,13■■□□□ 1,45
Sema6cQ9WTM3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,13■■□□□ 1,45
Sema6cQ9WTM3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,11■■□□□ 1,45
Sema6cQ9WTM3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24,1■■□□□ 1,45
Sema6cQ9WTM3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,1■■□□□ 1,45
Sema6cQ9WTM3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24,1■■□□□ 1,45
Sema6cQ9WTM3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,09■■□□□ 1,45
Sema6cQ9WTM3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24,09■■□□□ 1,45
Sema6cQ9WTM3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24,09■■□□□ 1,45
Sema6cQ9WTM3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,09■■□□□ 1,45
Sema6cQ9WTM3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,07■■□□□ 1,44
Sema6cQ9WTM3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,06■■□□□ 1,44
Sema6cQ9WTM3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,06■■□□□ 1,44
Sema6cQ9WTM3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24,06■■□□□ 1,44
Sema6cQ9WTM3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24,05■■□□□ 1,44
Sema6cQ9WTM3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24,05■■□□□ 1,44
Sema6cQ9WTM3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,05■■□□□ 1,44
Sema6cQ9WTM3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24,04■■□□□ 1,44
Sema6cQ9WTM3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24,01■■□□□ 1,43
Sema6cQ9WTM3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1,43
Sema6cQ9WTM3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1,43
Sema6cQ9WTM3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,99■■□□□ 1,43
Sema6cQ9WTM3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,99■■□□□ 1,43
Sema6cQ9WTM3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,98■■□□□ 1,43
Sema6cQ9WTM3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23,98■■□□□ 1,43
Sema6cQ9WTM3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,97■■□□□ 1,43
Sema6cQ9WTM3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,97■■□□□ 1,43
Sema6cQ9WTM3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,96■■□□□ 1,43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,8 ms